222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3872 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  100 
 
 		 67 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  100 
 
 		 67 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  69.7 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  60.61 
 
 		 69 aa  87.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1337  TOBE domain-containing protein  61.19 
 
 		 74 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  60.29 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0612  TOBE domain protein  62.12 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  63.64 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  58.82 
 
 		 68 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  62.12 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  62.12 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  60.61 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  59.09 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  58.21 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  65.15 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  59.09 
 
 		 69 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  63.64 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  58.21 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  59.09 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  54.55 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  53.03 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0609  TOBE domain protein  52.94 
 
 		 68 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00563993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  57.58 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  58.82 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  57.58 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  57.35 
 
 		 263 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  51.52 
 
 		 269 aa  67.4  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  51.52 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 269 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3573  TOBE domain-containing protein  59.7 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114567  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  46.27 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  54.69 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2558  molybdenum-pterin binding protein  49.25 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127714  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  47.76 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  49.25 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  45.45 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  50.75 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  47.69 
 
 		 260 aa  60.1  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  50.77 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  47.76 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  47.76 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  50.75 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  47.76 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  48.48 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  51.52 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  47.76 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  47.76 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  47.76 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  45.45 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  47.06 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1559  molybdenum-pterin binding protein  50.75 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0856932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  43.94 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  46.27 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  49.23 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  43.94 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  42.65 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  39.39 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  45.45 
 
 		 269 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  40.91 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  46.27 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  46.27 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  42.42 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  49.25 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  46.97 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  43.28 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1774  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  45.45 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3442  TOBE domain protein  44.78 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.650149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  47.69 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  45.31 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  42.42 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  46.15 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 281 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 281 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 278 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1839  molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  50.75 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1236  molybdenum-pterin binding protein, putative  41.54 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1993  molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2498  molybdenum-pterin binding protein, putative  40 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1722  putative molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0278  TOBE domain-containing protein  48.44 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0379  putative molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0391614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1824  molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0782  putative molybdenum-pterin binding protein  41.54 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  46.97 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  43.94 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  46.27 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  43.08 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 279 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>