56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3757 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1083    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  48.59 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  48.13 
 
 		 533 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  39.56 
 
 		 541 aa  352  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  31.85 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  28.62 
 
 		 520 aa  193  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  24.87 
 
 		 537 aa  139  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  23.46 
 
 		 569 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  23.46 
 
 		 569 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  29.71 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.49 
 
 		 353 aa  54.3  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  46.94 
 
 		 1061 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.62 
 
 		 674 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  39.58 
 
 		 650 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  39.71 
 
 		 917 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.4 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  46.67 
 
 		 373 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  22.33 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  44.44 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 		 339 aa  48.5  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  44.44 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  44.44 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  44.44 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  44.44 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  44.44 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  44.44 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  44.44 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  44.44 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  44.44 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.48 
 
 		 590 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  47.62 
 
 		 910 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3830  hypothetical protein  35.71 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531313  hitchhiker  0.000259973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  46.3 
 
 		 664 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4244  hypothetical protein  35.71 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28 
 
 		 762 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  40.82 
 
 		 773 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  34 
 
 		 634 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  36.73 
 
 		 355 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  36 
 
 		 369 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  27.86 
 
 		 688 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  21.78 
 
 		 780 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  39.58 
 
 		 384 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  42 
 
 		 359 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  29.35 
 
 		 681 aa  44.3  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  36 
 
 		 372 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  43.18 
 
 		 387 aa  44.3  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.5 
 
 		 689 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  34 
 
 		 362 aa  43.9  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  44 
 
 		 382 aa  43.9  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  44.74 
 
 		 345 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  30.08 
 
 		 582 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0003  DNA replication and repair protein RecF  41.86 
 
 		 362 aa  43.9  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000176519  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  29.93 
 
 		 707 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  42.55 
 
 		 529 aa  43.5  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  41.3 
 
 		 346 aa  43.5  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.97 
 
 		 708 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>