More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3728 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  99.49 
 
 
196 aa  386  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3728  putative acyl carrier protein phosphodiesterase  100 
 
 
196 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3238  hypothetical protein  86.89 
 
 
196 aa  325  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  54.08 
 
 
191 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50 
 
 
202 aa  186  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.91 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.13 
 
 
199 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.56 
 
 
216 aa  157  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  43.28 
 
 
199 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  39.47 
 
 
192 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  42.64 
 
 
199 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
198 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.47 
 
 
198 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.86 
 
 
198 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.47 
 
 
198 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.86 
 
 
198 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
198 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 
198 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.31 
 
 
198 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.89 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.2 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.31 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  41.41 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  40.4 
 
 
237 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.4 
 
 
237 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  40.4 
 
 
237 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  40.4 
 
 
237 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  40.4 
 
 
237 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.4 
 
 
198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.4 
 
 
198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.2 
 
 
199 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 
198 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.2 
 
 
199 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.2 
 
 
204 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41 
 
 
199 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 
197 aa  141  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.61 
 
 
207 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.2 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.71 
 
 
209 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  42.93 
 
 
208 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.01 
 
 
208 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.01 
 
 
208 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.31 
 
 
213 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.84 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  39.29 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0354  FMN-dependent NADH-azoreductase 1  52.54 
 
 
214 aa  131  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  38.78 
 
 
201 aa  131  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  40.4 
 
 
194 aa  130  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  38.89 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.42 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  38.27 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.84 
 
 
217 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.04 
 
 
202 aa  127  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  38 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  38.5 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  38.5 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  38.5 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  37 
 
 
201 aa  125  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.7 
 
 
206 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  38.5 
 
 
197 aa  124  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  37 
 
 
201 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  37.5 
 
 
201 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.79 
 
 
204 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  37 
 
 
201 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  40.76 
 
 
201 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.82 
 
 
202 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.31 
 
 
214 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.74 
 
 
202 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.31 
 
 
214 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  39.39 
 
 
213 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.96 
 
 
232 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.64 
 
 
198 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  36.92 
 
 
197 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  37 
 
 
201 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.18 
 
 
207 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  37 
 
 
201 aa  121  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.9 
 
 
204 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.76 
 
 
200 aa  121  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  37.91 
 
 
201 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  37 
 
 
198 aa  121  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  37 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.4 
 
 
206 aa  121  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  37 
 
 
201 aa  121  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.11 
 
 
216 aa  121  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.38 
 
 
212 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  37.91 
 
 
201 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  37.91 
 
 
201 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  37.91 
 
 
201 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  37.91 
 
 
201 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.5 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  36.5 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  36.5 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.9 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  37.75 
 
 
198 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.61 
 
 
209 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  37.63 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  35.96 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.86 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  37.25 
 
 
198 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  37.25 
 
 
198 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>