More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3716 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3716  selenophosphate synthetase  100 
 
 		 351 aa  686    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3450  selenophosphate synthetase  99.72 
 
 		 351 aa  683    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111292  normal  0.645552 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  87.43 
 
 		 351 aa  587  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  77.08 
 
 		 357 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  74.36 
 
 		 355 aa  517  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  73.82 
 
 		 369 aa  511  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  73.18 
 
 		 356 aa  494  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  72.89 
 
 		 356 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  67.54 
 
 		 354 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  70.55 
 
 		 357 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  70.47 
 
 		 360 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  67.75 
 
 		 353 aa  478  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  66.57 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  69.16 
 
 		 357 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  68.59 
 
 		 354 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  68.59 
 
 		 357 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  70.64 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  70.35 
 
 		 354 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  70.35 
 
 		 354 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  71.01 
 
 		 389 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  69.12 
 
 		 354 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  69.12 
 
 		 357 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  69.12 
 
 		 357 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  70.35 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  70.88 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  68.82 
 
 		 357 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  66.19 
 
 		 671 aa  454  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  70.35 
 
 		 385 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  65.99 
 
 		 358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  68.44 
 
 		 389 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  65.82 
 
 		 354 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  62.35 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  66.96 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  63.88 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  61.89 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  62.03 
 
 		 346 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  55.36 
 
 		 350 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  60.12 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  61.7 
 
 		 347 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  57.83 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  58.55 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  58.4 
 
 		 350 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  57.89 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  59.25 
 
 		 349 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  50.46 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  50.46 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  50.15 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  52.41 
 
 		 344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  51.22 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  51.22 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  49.85 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  48.38 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  48.8 
 
 		 351 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  49.85 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  48.27 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  47.24 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  49.85 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  48.66 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  49.85 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  48.58 
 
 		 352 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  49.85 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  49.85 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  49.85 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  48.58 
 
 		 352 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  51.22 
 
 		 344 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  49.85 
 
 		 347 aa  309  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  48.62 
 
 		 347 aa  309  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  51.48 
 
 		 344 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  47.97 
 
 		 347 aa  308  8e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  49.85 
 
 		 347 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  48.3 
 
 		 352 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  50.91 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  49.54 
 
 		 347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  47.11 
 
 		 351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  47.89 
 
 		 352 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  47.79 
 
 		 352 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  48.66 
 
 		 352 aa  305  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  50.91 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  46.57 
 
 		 352 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  50.61 
 
 		 344 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  47.58 
 
 		 359 aa  301  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  46.27 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  50.76 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  48.8 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  50.95 
 
 		 352 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  48.8 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  48.8 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  48.8 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  49.07 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  50.88 
 
 		 345 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  47.87 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  47.72 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3755  selenophosphate synthetase  48.84 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  49.55 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  46.53 
 
 		 353 aa  286  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  45.35 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3011  selenide, water dikinase  46.67 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  47.08 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  46.87 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  49.11 
 
 		 351 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>