194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3678 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3678  siderophore-interacting protein  100 
 
 		 345 aa  682    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3413  siderophore-interacting protein  97.97 
 
 		 345 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2496  siderophore-interacting protein  34.66 
 
 		 333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0728  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.05 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.198536  normal  0.463503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6722  Siderophore-interacting protein  29.29 
 
 		 349 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  35.9 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  31.88 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.17 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  33.93 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  38.35 
 
 		 247 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4656  Siderophore-interacting protein  43.27 
 
 		 261 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  37.29 
 
 		 266 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1773  siderophore-interacting protein  31.95 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3931  hypothetical protein  34.91 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal  0.760126 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4240  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  39.49 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  30.71 
 
 		 288 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  27.5 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  35.51 
 
 		 273 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  40.46 
 
 		 277 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  31.64 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  32.63 
 
 		 280 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  31.79 
 
 		 257 aa  89.4  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  35.47 
 
 		 623 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30.92 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  33.33 
 
 		 617 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.92 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  32.89 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  38.51 
 
 		 284 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  32.46 
 
 		 277 aa  85.9  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  31.32 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.28 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  32.89 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  33.98 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  36.77 
 
 		 276 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.21 
 
 		 253 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.43 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2932  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.06 
 
 		 275 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453632  hitchhiker  0.000505579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  34.35 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.21 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.46 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  34.81 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  28.81 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  37.65 
 
 		 297 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.3 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  26.36 
 
 		 246 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  28.69 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  30.08 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.43 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  35.16 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  28.82 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  26.21 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.4 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  30.77 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  26.21 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  28.38 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2440  siderophore-interacting protein  32.09 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  30.26 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.46 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  30.48 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.05 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  34.12 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12909  mycobactin utilization protein viuB  35.23 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000043443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.26 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2595  siderophore-interacting protein  29.05 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0509214  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  35.85 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.55 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  30 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.88 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  31.95 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  26.94 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  34.41 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.95 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0652  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.19 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  30.8 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  31.13 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  31.13 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.18 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2292  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.19 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636042  normal  0.986884 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  31.13 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  31.13 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  31.13 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  31.13 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  31.13 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.96 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5386  Siderophore-interacting protein  29.92 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0562315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  30.32 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  33.33 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.18 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  33.71 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  29.18 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  36 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.76 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2220  Siderophore-interacting protein  31.82 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683509  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  28.15 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  34.88 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30.6 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  28.76 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  28.76 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.94 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.9 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>