More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3664 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  99.14 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.37 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  40.73 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  40.52 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  40.52 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  41.42 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  41 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  41 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  41.48 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  38.2 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 268 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  40.95 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  40.54 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  39.11 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  38.57 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  39.91 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  40.09 
 
 		 249 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  42.11 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  40.09 
 
 		 249 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  40.09 
 
 		 249 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  43.86 
 
 		 299 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  37.97 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  37.39 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  41.41 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  42.61 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 247 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  38.7 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  39.66 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  38.2 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  39.65 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  39.66 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  38.33 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  40.77 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  42.17 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  38.1 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  38.74 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  39.66 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  43.04 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  39.82 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  39.32 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  38.33 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  39.04 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  38.05 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  34.98 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  36.64 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  39.3 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  39.65 
 
 		 233 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  37.39 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  36.52 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  39.21 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  36.09 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  32.7 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  35.71 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  41.01 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  32.23 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  34.32 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  32.9 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  38.43 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  34.07 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  32.94 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  35.23 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  37.27 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  34.91 
 
 		 229 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  34.47 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  35.48 
 
 		 227 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  37 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  37.43 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  34.04 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  34.96 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>