238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3623 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  100 
 
 		 373 aa  760    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  95.82 
 
 		 360 aa  663    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  81.89 
 
 		 360 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  54.71 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  50.43 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  42.53 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  41.02 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  40.82 
 
 		 344 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  37.4 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  39 
 
 		 311 aa  193  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  35.56 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  31.98 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  34.37 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  35.83 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  28.46 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  25.98 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  25.67 
 
 		 359 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  26.98 
 
 		 329 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  29.48 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  28.66 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  26.07 
 
 		 421 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  27.65 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  25.52 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  31.76 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  26.23 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  30.25 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1741  Phage integrase  27.54 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  26.45 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  30.25 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  23 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  25.25 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  28.76 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  23.57 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  28.81 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  26.79 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  26.42 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  24.38 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  24.76 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  26.8 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  28.92 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  26.47 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.45 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  25.9 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  27.81 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  24.79 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  28.51 
 
 		 327 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  27 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  27.63 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  31.88 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  26.91 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  28.01 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  30.69 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  30.15 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  24.75 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  23.87 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  26.78 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  23.46 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  26.78 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  27.46 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  26.81 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  27.2 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  31.75 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  23.46 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  23.92 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  25.4 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  25.67 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  27.34 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  30.89 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  25 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  28.05 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  33.06 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  23.73 
 
 		 344 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  28.57 
 
 		 431 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  30.32 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  27.75 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  28.71 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  29.08 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  31.45 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  28.36 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  29.11 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.71 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  31.3 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  30.65 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  30.65 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  23.91 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  25.2 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  26.37 
 
 		 434 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  23.4 
 
 		 426 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  29.49 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  31.9 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>