More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3599 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  697    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  97.05 
 
 		 339 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  100 
 
 		 346 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  78.37 
 
 		 337 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  70.41 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  72.56 
 
 		 375 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  67.82 
 
 		 373 aa  465  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  57.59 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  55.15 
 
 		 353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  53.64 
 
 		 344 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  54.71 
 
 		 379 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  56.73 
 
 		 333 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  56.29 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  52.51 
 
 		 363 aa  332  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  52.89 
 
 		 351 aa  332  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  53.17 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  52.74 
 
 		 351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  55.97 
 
 		 327 aa  328  7e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  52.98 
 
 		 345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  53.35 
 
 		 348 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  52.62 
 
 		 352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  51.48 
 
 		 357 aa  325  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  52.27 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  51.75 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  50.76 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  51.06 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  53.24 
 
 		 355 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  50.76 
 
 		 350 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  53.87 
 
 		 335 aa  319  6e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  53.12 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  52.66 
 
 		 348 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  53.38 
 
 		 325 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  51.1 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  50.77 
 
 		 322 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  51.2 
 
 		 365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  50.31 
 
 		 341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  49.39 
 
 		 330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  52.43 
 
 		 338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  52.87 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  53.02 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  52.48 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  52.48 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  50.93 
 
 		 351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  52.48 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  50.94 
 
 		 323 aa  302  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  49.36 
 
 		 347 aa  301  9e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  50.46 
 
 		 352 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  50.46 
 
 		 352 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  48.56 
 
 		 354 aa  298  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  48.56 
 
 		 359 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  52.15 
 
 		 368 aa  298  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  50.78 
 
 		 319 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  52.15 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  48.56 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  49.85 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  51.9 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00628  predicted protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  49.54 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2966  PhoH family protein  49.54 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.069683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2985  PhoH family protein  49.54 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  50.62 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00619  hypothetical protein  49.54 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0753  PhoH family protein  49.54 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00493548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0682  PhoH family protein  49.54 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0121436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0689  PhoH family protein  49.54 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018585  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  48.08 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0707  PhoH family protein  49.54 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0340161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  50.15 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  52.68 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3528  PhoH-like protein  51.52 
 
 		 340 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.959961  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  48.4 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  49.54 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  49.54 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  49.54 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  48.42 
 
 		 340 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  49.54 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  49.54 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1186  PhoH family protein  50.31 
 
 		 348 aa  295  5e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  49.53 
 
 		 316 aa  296  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  47.35 
 
 		 370 aa  295  7e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  50.94 
 
 		 328 aa  295  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  49.52 
 
 		 356 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  50.8 
 
 		 348 aa  295  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  49.54 
 
 		 351 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  49.04 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  49.84 
 
 		 316 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  51.21 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  49.69 
 
 		 335 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1495  PhoH-like protein  47.76 
 
 		 323 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  49.56 
 
 		 369 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  47.76 
 
 		 323 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  49.38 
 
 		 350 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  50.61 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  50.32 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  51.09 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  49.7 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  50 
 
 		 319 aa  293  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  49.69 
 
 		 335 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  49.36 
 
 		 348 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  50.16 
 
 		 320 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  49.69 
 
 		 353 aa  292  7e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>