More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3492 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  100 
 
 		 248 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  96.81 
 
 		 251 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  52.92 
 
 		 258 aa  207  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  45.29 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  43.16 
 
 		 463 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  42.36 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.73 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  40.6 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  46.52 
 
 		 348 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  38.86 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  40.42 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  43.05 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  42.11 
 
 		 463 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  40.42 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  40.53 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.06 
 
 		 237 aa  151  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.53 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  38.96 
 
 		 323 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  44.35 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  43.78 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.43 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 395 aa  148  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  41.92 
 
 		 320 aa  148  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  42.6 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  41.82 
 
 		 452 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  41.3 
 
 		 505 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  38.75 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  41.99 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  39.27 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  42.11 
 
 		 234 aa  145  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  43.75 
 
 		 256 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  41.56 
 
 		 394 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  41.56 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  38.87 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  42.48 
 
 		 421 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  38.4 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  43.04 
 
 		 381 aa  141  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  42.79 
 
 		 293 aa  141  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  38.77 
 
 		 449 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  36.09 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  35.34 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  40.09 
 
 		 441 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  40.91 
 
 		 241 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  41.13 
 
 		 472 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  39.82 
 
 		 425 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  37.76 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  35.17 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  38.82 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  36.21 
 
 		 478 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  38 
 
 		 574 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  35.59 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.25 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  34.63 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  31.36 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  34.63 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  40.4 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  37.97 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  40.25 
 
 		 477 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.78 
 
 		 482 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  39.65 
 
 		 554 aa  132  5e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  39.74 
 
 		 558 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.12 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  37.99 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  38.77 
 
 		 466 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 567 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  41.92 
 
 		 422 aa  132  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  40.26 
 
 		 519 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  36.99 
 
 		 270 aa  131  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  36.55 
 
 		 417 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  42.17 
 
 		 469 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.01 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  36.17 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  38.6 
 
 		 426 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  37.71 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.22 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  38.26 
 
 		 571 aa  129  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  41.52 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  40 
 
 		 564 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  33.05 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 		 241 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3671  putative serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  40.87 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  46.35 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  36.65 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  35.59 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  38.89 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  40.91 
 
 		 514 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  35.02 
 
 		 548 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1982  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.17 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.59 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  37.17 
 
 		 474 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  36.33 
 
 		 597 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>