55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3483 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  95.35 
 
 		 409 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  797    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  59.56 
 
 		 411 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 		 480 aa  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  38.59 
 
 		 508 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  23.44 
 
 		 458 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  36.36 
 
 		 554 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  38.27 
 
 		 180 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  35.83 
 
 		 645 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  34.54 
 
 		 681 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  35.71 
 
 		 541 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  41.18 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  27.91 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  29.4 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  22.63 
 
 		 397 aa  97.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  30.81 
 
 		 604 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  31.46 
 
 		 565 aa  86.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  29.79 
 
 		 572 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  23.69 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  41.86 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  30.65 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  36.05 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  30.81 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  28.41 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  27.27 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  28.46 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  28.46 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  28.41 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  28.95 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  28.46 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  28.46 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  30.37 
 
 		 777 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  31.97 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  30.92 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  30.53 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  21.91 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  21.91 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  28.97 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  32.98 
 
 		 108 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  30.59 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1179  putative type VI secretion protein VasC-1  37.68 
 
 		 314 aa  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  21.88 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  27.68 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1340  FHA domain containing protein  30.94 
 
 		 1481 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000482436 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  22.22 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  25.15 
 
 		 438 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  25.15 
 
 		 438 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  23.63 
 
 		 497 aa  46.6  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  33.07 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 		 851 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  22.22 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.36 
 
 		 557 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0150052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.09 
 
 		 606 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  34.55 
 
 		 770 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>