155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3477 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3477  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  350  5e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772504  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3121  hypothetical protein  99.43 
 
 		 176 aa  347  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241786  normal  0.0428701 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2443  hypothetical protein  84.21 
 
 		 180 aa  273  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.485859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0193  type VI secretion protein, VC_A0107 family  53.37 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  47.59 
 
 		 180 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  47.59 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  47.59 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  47.59 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3003  hypothetical protein  51.25 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6673  type VI secretion protein  46.37 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72757  normal  0.388479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  43.43 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0980  hypothetical protein  49.09 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  45.71 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26670  hypothetical protein (UCP028301)  48.47 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0155  hypothetical protein  47.13 
 
 		 172 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1479  type VI secretion protein  47.31 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  46.67 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3907  type VI secretion protein  49.7 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406432 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  46.67 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  46.67 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2871  hypothetical protein  47.31 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1367  hypothetical protein  47.31 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.466171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01010  hypothetical protein  46.55 
 
 		 172 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  46.91 
 
 		 179 aa  140  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3474  hypothetical protein  46.86 
 
 		 180 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279026  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2322  hypothetical protein  47.85 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239725  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  47.24 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2461  type VI secretion protein, VC_A0107 family  49.37 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  48.84 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0941  type VI secretion protein, VC_A0107 family  49.07 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  46.01 
 
 		 182 aa  137  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0550  type VI secretion protein, VC_A0107 family  47.62 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6114  type VI secretion protein  47.27 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3850  type VI secretion protein  47.24 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  45.66 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  45.66 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  45.66 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  45.66 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  47.88 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  47.88 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0403  hypothetical protein  45.09 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1600  hypothetical protein  45.09 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1783  hypothetical protein  45.09 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0453  hypothetical protein  45.09 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  47.95 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  46.99 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  45.78 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  46.99 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  45.78 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  46.99 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  46.99 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  45.78 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1588  hypothetical protein  46.2 
 
 		 184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149001  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1695  hypothetical protein  48.12 
 
 		 1238 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  46.91 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  42.51 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  42.37 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  42.37 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  42.37 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  42.37 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  41.14 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  44.97 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  38.36 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  40.23 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  40.49 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  40.49 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  40.49 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  40.49 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  40.49 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  40.49 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  41.1 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  38.1 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00266  hypothetical protein  42.47 
 
 		 150 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  36.48 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  35.85 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  38.79 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  40 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  38.65 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  40 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  35.03 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  35.03 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  35.03 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  36.69 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  36.88 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  36.53 
 
 		 167 aa  94.4  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  35 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  36.14 
 
 		 170 aa  91.7  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  35.71 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  34.94 
 
 		 177 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  34.55 
 
 		 191 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  33.94 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  34.55 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  34.55 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  33.13 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  34.27 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  34.27 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>