More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3458 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  97.97 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  63.33 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  61.07 
 
 		 244 aa  301  8.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  61.51 
 
 		 265 aa  300  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.43 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.75 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  58.85 
 
 		 286 aa  293  1e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  57.85 
 
 		 253 aa  294  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  57.2 
 
 		 246 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  60.49 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.67 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.58 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  58.92 
 
 		 256 aa  291  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  59.17 
 
 		 246 aa  291  7e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  58.51 
 
 		 257 aa  291  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  58.61 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  58.44 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  58.2 
 
 		 245 aa  289  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  57.5 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  57.03 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58.33 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 284 aa  288  6e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.61 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  56.43 
 
 		 242 aa  287  9e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  56.43 
 
 		 242 aa  287  9e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  58.75 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.97 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  57.08 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.68 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  58.55 
 
 		 249 aa  285  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  59.17 
 
 		 240 aa  284  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.25 
 
 		 240 aa  284  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  56.22 
 
 		 259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  54.17 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  57.44 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  52.46 
 
 		 246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  55.34 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  59.4 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  56.25 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  57.44 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  59.58 
 
 		 239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.25 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  58.02 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  59.17 
 
 		 242 aa  281  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  55.56 
 
 		 256 aa  281  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56.25 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  56.56 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.9 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  57.32 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  55.74 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  56.28 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  53.69 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  59.27 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  55.14 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  57.08 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  57.5 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  58.33 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  56.25 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  55.98 
 
 		 249 aa  279  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  54.17 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  56.35 
 
 		 259 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  57.26 
 
 		 251 aa  278  7e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  57.2 
 
 		 261 aa  278  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 256 aa  278  8e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  55 
 
 		 244 aa  278  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.51 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  59.83 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  56.15 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  56.15 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  55.91 
 
 		 262 aa  276  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  54.13 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  56.85 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.8 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>