125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3426 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3426  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  818    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3071  glutathionylspermidine synthase  99.25 
 
 		 400 aa  810    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.742359  normal  0.268432 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3591  hypothetical protein  73.89 
 
 		 406 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.274003  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1247  glutathionylspermidine synthase  64.2 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3849  glutathionylspermidine synthase  50.74 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5551  glutathionylspermidine synthase  49.37 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1405  glutathionylspermidine synthase  47.59 
 
 		 385 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5363  glutathionylspermidine synthetase  49.11 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5279  glutathionylspermidine synthase  48.86 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01618  glutathionylspermidine synthase  44.33 
 
 		 388 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3621  glutathionylspermidine synthase  46.1 
 
 		 386 aa  362  8e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0311  Trypanothione synthase  47.61 
 
 		 386 aa  359  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3446  glutathionylspermidine synthase  46.12 
 
 		 387 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3439  glutathionylspermidine synthase  46.12 
 
 		 387 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3374  glutathionylspermidine synthase  46.12 
 
 		 387 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3369  glutathionylspermidine synthase  46.12 
 
 		 387 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3541  glutathionylspermidine synthase  46.12 
 
 		 387 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02910  predicted enzyme  44.86 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0663  glutathionylspermidine synthase  44.86 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.553236  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3215  glutathionylspermidine synthase family protein  44.86 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3502  glutathionylspermidine synthase family protein  44.86 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000151418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0660  glutathionylspermidine synthase  44.86 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3332  glutathionylspermidine synthase family protein  44.86 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3470  glutathionylspermidine synthase family protein  44.86 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000295312  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0321  glutathionylspermidine synthase  47.36 
 
 		 386 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4351  glutathionylspermidine synthase family protein  44.86 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00967413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02860  hypothetical protein  44.86 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0571  putative glutathionylspermidine synthase  46.6 
 
 		 386 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0651  glutathionylspermidine synthase  46.6 
 
 		 386 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4275  glutathionylspermidine synthase  45.84 
 
 		 386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.747428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0287  hypothetical protein  46.35 
 
 		 386 aa  353  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3779  glutathionylspermidine synthase  46.85 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.326667  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003906  glutathionylspermidine synthase  43.36 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.763675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01335  putative glutathionylspermidine synthase  46.27 
 
 		 385 aa  348  7e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.971977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1219  glutathionylspermidine synthase  43.97 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3450  glutathionylspermidine synthase  44.61 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1698  glutathionylspermidine synthase  45.32 
 
 		 385 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231799  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3780  glutathionylspermidine synthase family protein  45.06 
 
 		 385 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5405  glutathionylspermidine synthase  45.57 
 
 		 384 aa  342  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6550  putative glutathionylspermidine synthase family protein  45.45 
 
 		 386 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02190  synthetase/amidase  45.25 
 
 		 388 aa  338  9e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5565  glutathionylspermidine synthase  45.57 
 
 		 384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4277  glutathionylspermidine synthase  47.09 
 
 		 386 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.124865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5199  glutathionylspermidine synthase  46.33 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4737  glutathionylspermidine synthase domain protein  43.8 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4644  glutathionylspermidine synthase domain protein  43.54 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4658  glutathionylspermidine synthase  45.82 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.46187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4794  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  43.54 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4653  glutathionylspermidine synthase domain protein  43.54 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04053  predicted synthetase/amidase  43.72 
 
 		 387 aa  328  7e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3827  glutathionylspermidine synthase  43.72 
 
 		 387 aa  328  7e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000494371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4773  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  43.29 
 
 		 387 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5702  glutathionylspermidine synthase domain protein  43.47 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.515802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5048  glutathionylspermidine synthase  43.32 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0509044 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3807  glutathionylspermidine synthase  43.22 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4657  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  43.72 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5121  glutathionylspermidine synthase  45.32 
 
 		 387 aa  326  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4430  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  43.22 
 
 		 387 aa  324  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4746  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  43.22 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.260545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3915  glutathionylspermidine synthase  43.8 
 
 		 385 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2241  glutathionylspermidine synthase  42.53 
 
 		 373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4889  glutathionylspermidine synthase  42.89 
 
 		 377 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1876  glutathionylspermidine synthase  40.66 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2484  glutathionylspermidine synthase  42.12 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0115  glutathionylspermidine synthase  39.55 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4716  glutathionylspermidine synthase domain protein  37.69 
 
 		 352 aa  259  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7051  glutathionylspermidine synthase  40.35 
 
 		 386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1573  glutathionylspermidine synthase  38.83 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0108547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01240  glutathionylspermidine synthase  38.81 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.636699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2359  glutathionylspermidine synthase  37.91 
 
 		 381 aa  242  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3053  glutathionylspermidine synthase  37.5 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00288809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2755  glutathionylspermidine synthase  38.48 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0039837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8737  glutathionylspermidine synthase  38.89 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2757  glutathionylspermidine synthase  37.07 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1327  glutathionylspermidine synthase  37.47 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1585  glutathionylspermidine synthase family protein  28.92 
 
 		 389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0421  glutathionylspermidine synthase family protein  29.62 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1553  glutathionylspermidine synthase family protein  28.61 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0396  glutathionylspermidine synthase family protein  29.62 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.338468  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0090  glutathionylspermidine synthase  31.04 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346525  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1541  glutathionylspermidine synthase family protein  29 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1647  glutathionylspermidine synthase subfamily protein  28.76 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1471  glutathionylspermidine synthase  29.61 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5050  glutathionylspermidine synthase  33.24 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1661  glutathionylspermidine synthase family protein  30.28 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3045  glutathionylspermidine synthase  29.82 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1235  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  25.2 
 
 		 629 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.114299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3723  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  27.99 
 
 		 642 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0216  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.33 
 
 		 625 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2978  putative glutathionylspermidine synthase  23.99 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0622059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2652  glutathionylspermidine synthetase  23.56 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4300  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  23.37 
 
 		 619 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2970  glutathionylspermidine synthase, putative  23.8 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129373  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2675  glutathionylspermidine synthase  23.32 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.484737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2931  putative glutathionylspermidine synthase  23.32 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0708  Glutathionylspermidine amidase  23.3 
 
 		 619 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3455  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  23.3 
 
 		 619 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0705  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  23.3 
 
 		 619 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3274  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  23.3 
 
 		 619 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3415  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  23.3 
 
 		 619 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>