147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3325 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  100 
 
 		 501 aa  978    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  98.8 
 
 		 501 aa  971    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  88.18 
 
 		 501 aa  836    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  58.37 
 
 		 504 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  58.16 
 
 		 504 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  59.08 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 		 508 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  41.68 
 
 		 514 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  33.47 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  32.71 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  34.94 
 
 		 509 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  35.96 
 
 		 575 aa  209  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  32.67 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  32.67 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  32.55 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  32.79 
 
 		 500 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  32.69 
 
 		 514 aa  169  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 		 487 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 		 484 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  30.64 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 487 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  26.88 
 
 		 492 aa  143  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 		 492 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  26.59 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  33.86 
 
 		 502 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  26.59 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  26.88 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  26.59 
 
 		 492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  26.59 
 
 		 492 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  26.59 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  27.37 
 
 		 493 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  28.76 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  26.88 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  25.2 
 
 		 510 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  25.2 
 
 		 510 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  25.2 
 
 		 510 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  25.2 
 
 		 510 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  25.72 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 487 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  29.87 
 
 		 486 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 503 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  30.2 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 489 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 		 502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  22.67 
 
 		 479 aa  114  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 		 448 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  24.46 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  24.46 
 
 		 474 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 497 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 480 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 487 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 424 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  23.74 
 
 		 505 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 		 504 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 494 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.24 
 
 		 488 aa  99.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 479 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  26.38 
 
 		 492 aa  98.6  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 502 aa  96.7  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 		 421 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 		 490 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  25.69 
 
 		 508 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 		 515 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 		 500 aa  93.6  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 503 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 493 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 484 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 499 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 472 aa  91.3  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 467 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 508 aa  90.5  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 492 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 		 493 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 507 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 		 484 aa  87.8  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 498 aa  87.4  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 502 aa  87  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  27.58 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  24.91 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.29 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 490 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.08 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>