211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3172 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  527  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  98.92 
 
 		 277 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  41.86 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  44.16 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4249  hypothetical protein  46.72 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  39.15 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  42.59 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  39.47 
 
 		 265 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  41.5 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  39.44 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  39.77 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  40.24 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  37.23 
 
 		 276 aa  146  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  40 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  39.44 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  39.04 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  39.04 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2046  hypothetical protein  44.69 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.391203  normal  0.958911 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  37.61 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  36.15 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  35.62 
 
 		 268 aa  142  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  37.4 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  36.29 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  36.15 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  36.54 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  32.95 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1927  hypothetical protein  39.53 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  39.61 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  37.88 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  37.8 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  41.81 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0578  hypothetical protein  39.13 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  42 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  35.83 
 
 		 266 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  35.55 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  36.36 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  39.67 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  37.35 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  34.89 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0366  hypothetical protein  39.39 
 
 		 278 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0322  hypothetical protein  36.36 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  34.35 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  34.39 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  34.9 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  38.29 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  35.37 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  34.84 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  35.74 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  34.84 
 
 		 264 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  35.16 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  38.85 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  34.62 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  36.94 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  34.04 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  30.89 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  37.26 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  39.41 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  35.27 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  33.63 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  36.17 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  35.12 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  39.18 
 
 		 268 aa  112  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  30.49 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  35.65 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  31.54 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  39.41 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  31.54 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  34.48 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01459  membrane protein  33.21 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  35.98 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  35.08 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  34.91 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  34.84 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  32.2 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  37.6 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  32.57 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  34.63 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  38.11 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  32.85 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  35 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  35 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  32.02 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  34.65 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  35.27 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  32.77 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  32.09 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  32.69 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05309  integral membrane transmembrane protein  32.44 
 
 		 273 aa  95.5  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  29.31 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  33.75 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  34.25 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  37.44 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  33.75 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  33.59 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  28.82 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  32.46 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>