78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3151 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3888  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  99.7 
 
 		 330 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3151  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 330 aa  672    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.64 
 
 		 334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1728  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  43.37 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5990  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.41 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.626097 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1399  ABC transporter periplasmic binding protein  39.2 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4505  NLPA lipoprotein  41.25 
 
 		 342 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.826664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1797  ABC transporter periplasmic binding protein  39.2 
 
 		 340 aa  252  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0340  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.41 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5195  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.72 
 
 		 339 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3455  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  40.33 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2205  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.87 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34770  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  42.02 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.0167014 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1388  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.83 
 
 		 317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03032  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  38.89 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.08661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2677  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.2 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  40.39 
 
 		 338 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  39.29 
 
 		 338 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3889  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.35 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  0.125658 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3152  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.35 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4122  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  38.89 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4009  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  38.89 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6690  putative periplasmic substrate-binding subunit (ABC transporter)  40.2 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1299  ABC transporter periplasmic binding protein  38.8 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2170  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  38.18 
 
 		 350 aa  235  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30880  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.77 
 
 		 339 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3603  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.57 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1120  ABC transporter, periplasmic binding protein  37.54 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.75 
 
 		 350 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.35 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00383664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0138  NLPA lipoprotein  38.39 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5060  ABC transporter substrate-binding protein  37.46 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4888  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  37.1 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal  0.144986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4137  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  41.28 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6250  ABC transporter substrate binding protein  40.87 
 
 		 351 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1244  ABC transporter substrate binding protein  41.01 
 
 		 343 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6192  ABC transporter substrate binding protein  41.01 
 
 		 343 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6588  ABC transporter substrate binding protein  41.01 
 
 		 343 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6535  ABC transporter substrate binding protein  40.73 
 
 		 351 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0170  ABC transporter, periplasmic binding protein  37.72 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0191  ABC transporter periplasmic-binding protein  37.72 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0512  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.65 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1687  ABC transporter substrate binding protein  40.73 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0818  ABC transporter substrate binding protein  40.73 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2032  ABC transporter substrate binding protein  40.73 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0343  ABC transporter substrate-binding protein  40.73 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1878  ABC transporter substrate binding protein  40.73 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1866  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.73 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346438  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2525  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.99 
 
 		 338 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74884  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5057  ABC transporter, periplasmic binding protein  37.23 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0189  ABC transporter, periplasmic binding protein  36.83 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0536  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  38.71 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00532956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30920  ABC transporter, periplasmic binding protein  36.77 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6244  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  37.65 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6049  ABC transporter substrate binding protein  40.07 
 
 		 351 aa  215  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3450  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.87 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302208  hitchhiker  0.000774086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1606  NLPA lipoprotein  36.67 
 
 		 346 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000297803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3930  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.28 
 
 		 341 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3590  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.28 
 
 		 341 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3496  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.45 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5326  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.45 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3259  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  30.72 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5095  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.73 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.296668  normal  0.288347 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.15 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1372  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.45 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5319  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  24.23 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1472  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  24.52 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.93 
 
 		 319 aa  46.2  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0114  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.68 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3846  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0095  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.68 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5012  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.52 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0114898  normal  0.178041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0105  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.68 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.28017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1487  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.143655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0087  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.71 
 
 		 340 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191531  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4266  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.36 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1799  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.88 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.3 
 
 		 341 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.460315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>