More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2906 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  100 
 
 
278 aa  517  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  98.2 
 
 
278 aa  510  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  79.92 
 
 
278 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  64.86 
 
 
275 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  56.87 
 
 
278 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  55.64 
 
 
276 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  54.34 
 
 
274 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  46.04 
 
 
325 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  45.09 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.94 
 
 
286 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  45.9 
 
 
319 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  46.43 
 
 
289 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  46.01 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.84 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  46.13 
 
 
317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  40 
 
 
301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.62 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  46.18 
 
 
285 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.69 
 
 
275 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.35 
 
 
285 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.49 
 
 
286 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.38 
 
 
296 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  42.24 
 
 
289 aa  175  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  43.61 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  43.43 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  43.53 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  45.14 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.57 
 
 
296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  38.77 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  46.57 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.63 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  44.81 
 
 
299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  48.4 
 
 
283 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  42.02 
 
 
295 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.4 
 
 
299 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  43.28 
 
 
284 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  47.33 
 
 
280 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  47.33 
 
 
280 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  40.38 
 
 
284 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.95 
 
 
280 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  41.63 
 
 
283 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.74 
 
 
280 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  35.69 
 
 
288 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  44.14 
 
 
289 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  36.2 
 
 
279 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.29 
 
 
289 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  44.29 
 
 
283 aa  168  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  43.6 
 
 
292 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  41.9 
 
 
304 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  44.33 
 
 
293 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.65 
 
 
296 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  44.02 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  39.86 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  41.64 
 
 
297 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  46.21 
 
 
280 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  42.29 
 
 
288 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.43 
 
 
279 aa  165  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  33.81 
 
 
359 aa  165  9e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  44.53 
 
 
270 aa  165  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  46.38 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  45.83 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  44.4 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  37.36 
 
 
284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  43.68 
 
 
295 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  39.85 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  41.44 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  38.65 
 
 
277 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.2 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  41.2 
 
 
283 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  37.46 
 
 
289 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.45 
 
 
280 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  43.18 
 
 
288 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  37.85 
 
 
288 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  45.68 
 
 
295 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  45.49 
 
 
285 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  47.1 
 
 
289 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  41.39 
 
 
284 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  39.3 
 
 
296 aa  159  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  45.49 
 
 
286 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  45.86 
 
 
286 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  37.72 
 
 
285 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  38.49 
 
 
279 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  35.21 
 
 
285 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  40.5 
 
 
287 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  38.65 
 
 
277 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  46.82 
 
 
287 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.45 
 
 
283 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  36.96 
 
 
330 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.49 
 
 
286 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  37.72 
 
 
277 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  44.83 
 
 
286 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  36.97 
 
 
280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  32.87 
 
 
283 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.87 
 
 
283 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  47.19 
 
 
276 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.02 
 
 
297 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  32.87 
 
 
283 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  31.37 
 
 
361 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  32.87 
 
 
283 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0855  modification methylase HemK  35.4 
 
 
280 aa  154  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>