More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2888 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1534  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353948  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2888  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1131  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  97.22 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1660  transcriptional regulator  61.54 
 
 		 150 aa  180  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2272  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 154 aa  169  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257031  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  40.43 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  43.97 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  43.97 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  43.97 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1445  iron-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.11 
 
 		 159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.75 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.15 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.15 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.35 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.55 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  41.98 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  41.98 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  41.98 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0421  iron-responsive transcriptional regulator  42.36 
 
 		 160 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531604  hitchhiker  0.00267682 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  41.98 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  41.98 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  41.98 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  41.98 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  41.98 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0389  iron-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00187363  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.209804  normal  0.479131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  41.98 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00085  YhdE (NsrR)  39.1 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2769  transcriptional repressor NsrR  41.26 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  41.13 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.36 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.56 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  38.19 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.370774  hitchhiker  0.00270297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0047  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000883142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0041  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0191012  hitchhiker  0.000277794 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.28 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  40.28 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  40.28 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  40.28 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  40.28 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  40.28 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4474  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 151 aa  105  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000199058  hitchhiker  0.00000000296889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.85 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  38.19 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  36.55 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4881  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0043  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.06 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000767573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0045  Rrf2 family protein  37.06 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  38.89 
 
 		 141 aa  104  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  37.5 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  37.5 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  39.58 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0036  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  39.58 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4279  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  36.69 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  40.46 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  39.58 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.86 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.58 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  39.58 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  39.58 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  33.57 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.55 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  39.58 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  39.58 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  38.89 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  38.89 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  32.64 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0056  Rrf2 family protein  37.76 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0941015  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  32.64 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.62 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1883  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00237919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0518  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0438222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>