41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2582 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  748    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  88.32 
 
 		 393 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  98.64 
 
 		 394 aa  742    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  65.38 
 
 		 395 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  59.78 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  61.16 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  51.76 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  52.82 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  45.45 
 
 		 386 aa  301  9e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  46.97 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  46.69 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  46.69 
 
 		 427 aa  292  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  44.1 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  44.66 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  44.3 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  44.31 
 
 		 367 aa  285  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  44.25 
 
 		 423 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  41.97 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  46.05 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  38.21 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  40.85 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  43.66 
 
 		 411 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  41.93 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  42.58 
 
 		 408 aa  259  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  38.25 
 
 		 400 aa  258  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  42.02 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  41.88 
 
 		 416 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  41.74 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  38.35 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  40.51 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  38.62 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  38.12 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  39.93 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  36.06 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  36.75 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  23.13 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  23.51 
 
 		 432 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  23.46 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>