143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2548 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  100 
 
 		 410 aa  808    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  100 
 
 		 410 aa  808    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  86.13 
 
 		 411 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  37.39 
 
 		 427 aa  225  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  31.25 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  34.13 
 
 		 422 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  34.89 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 438 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  33.53 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  32.67 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  31.8 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 452 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  32.24 
 
 		 442 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  31.13 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  28.75 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  28.5 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  27.41 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  24.8 
 
 		 529 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  26.74 
 
 		 816 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  34.62 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  26.88 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  26.17 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  25 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  36.44 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  38.14 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  35.54 
 
 		 177 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.29 
 
 		 152 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  40 
 
 		 153 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  36.8 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  36.8 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  28.32 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  34.15 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  26.2 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  34.11 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  38.4 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  37.29 
 
 		 234 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  27.08 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  25.2 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  35.79 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 235 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 235 aa  67  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  38.14 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  37.76 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  39.08 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  25.28 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  38.14 
 
 		 189 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  35.48 
 
 		 185 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  34.86 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  24.18 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  37.93 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  34.81 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  35.48 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  30 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 196 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  26.67 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  33.82 
 
 		 238 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  38.89 
 
 		 193 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  26.72 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  35.87 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4073  hypothetical protein  27.61 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000220985  normal  0.0992314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  34.04 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  38 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  28.91 
 
 		 186 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.57 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  31.36 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.65 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 195 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  36.73 
 
 		 220 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.95 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  26.79 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.75 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  28.4 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.79 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.81 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  32.94 
 
 		 192 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.27 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  27.64 
 
 		 192 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  27.64 
 
 		 192 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  29.8 
 
 		 214 aa  50.4  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 192 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  35.54 
 
 		 192 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 237 aa  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.54 
 
 		 192 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.54 
 
 		 192 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.39 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.24 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.09 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 205 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>