More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2522 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2522  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 
345 aa  675    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1184  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 
341 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503975  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1998  NADH dehydrogenase subunit H  95.65 
 
 
345 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222188  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1321  NADH dehydrogenase subunit H  83.48 
 
 
345 aa  544  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967577  normal  0.0180993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0753  NADH dehydrogenase subunit H  82.32 
 
 
345 aa  529  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112017  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2239  NADH dehydrogenase subunit H  77.39 
 
 
345 aa  507  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1185  NADH dehydrogenase subunit H  79.3 
 
 
346 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317431  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  63.11 
 
 
340 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4626  NADH dehydrogenase subunit H  64.08 
 
 
339 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0842951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  63.11 
 
 
340 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  62.8 
 
 
340 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  63.11 
 
 
340 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  58.81 
 
 
341 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  65.89 
 
 
342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  59.7 
 
 
341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  62.84 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  65.78 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2925  NADH dehydrogenase subunit H  67.01 
 
 
342 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  62.7 
 
 
347 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3291  NADH dehydrogenase subunit H  59.4 
 
 
341 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347185  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  61.22 
 
 
347 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  62.66 
 
 
337 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  61.41 
 
 
347 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  60.77 
 
 
347 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1880  NADH dehydrogenase subunit H  59.28 
 
 
356 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.517536  normal  0.265736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2411  NADH dehydrogenase subunit H  60.3 
 
 
341 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_004310  BR0809  NADH dehydrogenase subunit H  62.94 
 
 
347 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519776  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2416  NADH dehydrogenase subunit H  62.62 
 
 
347 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792289  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0804  NADH dehydrogenase subunit H  62.62 
 
 
347 aa  381  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0785  NADH dehydrogenase subunit H  60.25 
 
 
348 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.181346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4554  NADH dehydrogenase subunit H  58.08 
 
 
356 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2213  NADH dehydrogenase subunit H  59.88 
 
 
356 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0909649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1362  NADH dehydrogenase subunit H  64.03 
 
 
356 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.1215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1029  NADH dehydrogenase subunit H  58.51 
 
 
347 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  56.44 
 
 
337 aa  361  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2826  NADH dehydrogenase subunit H  57.85 
 
 
357 aa  352  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.276364  normal  0.0731875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  56.65 
 
 
347 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  55.41 
 
 
338 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  54.43 
 
 
341 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  57.91 
 
 
348 aa  328  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  51.18 
 
 
367 aa  321  9.999999999999999e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  50.89 
 
 
369 aa  319  5e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.54 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  48.87 
 
 
349 aa  311  9e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2293  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  53.73 
 
 
347 aa  309  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  50.33 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  49.85 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  47.2 
 
 
352 aa  306  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.65 
 
 
344 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  45.23 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  45.23 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  48.06 
 
 
340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.45 
 
 
349 aa  302  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  47.44 
 
 
340 aa  302  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.53 
 
 
339 aa  300  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.3 
 
 
366 aa  298  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  48.32 
 
 
341 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  48.32 
 
 
341 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.79 
 
 
336 aa  295  5e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  44.51 
 
 
354 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.1 
 
 
339 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  48 
 
 
341 aa  292  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 
354 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 
354 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  46.89 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  43.29 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.56 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.06 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  44.69 
 
 
354 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  47.43 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  43.82 
 
 
354 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  43.86 
 
 
352 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  43.82 
 
 
354 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  43.86 
 
 
352 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  43.82 
 
 
354 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  43.82 
 
 
354 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  43.86 
 
 
352 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  45.57 
 
 
333 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  43.24 
 
 
363 aa  279  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.08 
 
 
360 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  46.2 
 
 
322 aa  279  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  44.68 
 
 
354 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  43.24 
 
 
363 aa  278  7e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  43.07 
 
 
364 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  44.68 
 
 
354 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.71 
 
 
359 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.76 
 
 
347 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01294  NADH dehydrogenase subunit H  43.03 
 
 
363 aa  275  9e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  44.59 
 
 
358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  44.55 
 
 
458 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  45.57 
 
 
355 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  45.57 
 
 
355 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  43.71 
 
 
352 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  45.25 
 
 
355 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  43.99 
 
 
354 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  44.55 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  44.54 
 
 
430 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.27 
 
 
358 aa  269  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  45.25 
 
 
355 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.41 
 
 
360 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.18008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>