132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2468 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  100 
 
 		 391 aa  788    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  98.72 
 
 		 390 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1075  HK97 family phage portal protein  89.26 
 
 		 388 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.529897  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  70.88 
 
 		 400 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  70.26 
 
 		 396 aa  547  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  67.6 
 
 		 401 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  67.62 
 
 		 386 aa  519  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  55.06 
 
 		 393 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  56.23 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  55.76 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  55.32 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  53.89 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  54.33 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  52.01 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  51.74 
 
 		 391 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  55.61 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  52.86 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  54.57 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  52.07 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  55.59 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  55.87 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  49.35 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  49.35 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  41.6 
 
 		 393 aa  315  9e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  41 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  42.31 
 
 		 397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  50.89 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.38293 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  46.67 
 
 		 389 aa  282  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  36.92 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  47.38 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  42.42 
 
 		 477 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  30.65 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  26.71 
 
 		 524 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  28.73 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  28.42 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  26.28 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  27.05 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  28.37 
 
 		 413 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  28.37 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  28.37 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  28.18 
 
 		 1102 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  29.06 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  27.12 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  23.13 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  23.81 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  24.56 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  24.91 
 
 		 414 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  24.23 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  28.06 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  26.86 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  25.99 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  27.27 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  27.27 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  24.91 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  23.72 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  24.35 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  26.96 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  27.97 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  26.97 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  27.3 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  24.68 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  26.53 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  24.91 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  24.68 
 
 		 445 aa  72.8  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  24.83 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  25.14 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  28.24 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  25.09 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  24.46 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  24.46 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3880  portal protein  24.36 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100107  normal  0.024166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  27.55 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  23.33 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  25.93 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  24.28 
 
 		 859 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  24.28 
 
 		 833 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  23.39 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  24.28 
 
 		 833 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  21.61 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  21.61 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  23.91 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  21.61 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  25.68 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  24.03 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  25.29 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  25.98 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  26.46 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  25.78 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  24.04 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  24.13 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  25.81 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  23.47 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  27.21 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  24.58 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  26.52 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  24.47 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  26.82 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  21.75 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  25.71 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  25.3 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>