140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2360 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  100 
 
 		 397 aa  805    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  46.65 
 
 		 416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  38.87 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  37.5 
 
 		 407 aa  259  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  37.59 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  38.35 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  41.44 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  40.72 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  41.37 
 
 		 412 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  40.21 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  35.26 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  34.08 
 
 		 440 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  33.06 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  35.44 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  35.16 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  32.3 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  31.49 
 
 		 414 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  31.49 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  36.83 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  31.87 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  33.06 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  33.14 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  32.49 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  31.47 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  31.36 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  30.93 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  29.57 
 
 		 425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  29.57 
 
 		 425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  29.57 
 
 		 425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  29.2 
 
 		 524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  29.72 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  29.17 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  27.99 
 
 		 426 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  30.15 
 
 		 413 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  30.15 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  32.27 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  28.1 
 
 		 417 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  29.09 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  31.29 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  29.03 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  27.88 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  27.94 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  30.59 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  29.52 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  28.18 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  25.29 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  27.62 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  27.85 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  25.51 
 
 		 419 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  28.25 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  31.67 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  29.94 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  28.49 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  26.41 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  29.64 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  28.16 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  30.62 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  29.49 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  26.7 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  27.59 
 
 		 417 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  23.54 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  23.54 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  25.63 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  23.34 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  24.37 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  24.6 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  27.37 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  28.09 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  25.84 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  29.95 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  24.5 
 
 		 432 aa  96.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  24.87 
 
 		 416 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  24.6 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  24.78 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  27.49 
 
 		 447 aa  93.6  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25.73 
 
 		 454 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25.73 
 
 		 454 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  28.96 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  27.55 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  26.39 
 
 		 859 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  24.86 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  26.88 
 
 		 833 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  26.88 
 
 		 833 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  25.85 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  27.68 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.59 
 
 		 441 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  23.99 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  25 
 
 		 455 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  25.89 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  28.28 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  25.54 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  25.54 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  23.93 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  25.91 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  23.82 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  25.71 
 
 		 542 aa  82.8  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  29.06 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  29.15 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  29.9 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  25.26 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>