More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2170 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  90.48 
 
 
504 aa  854    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  99.41 
 
 
505 aa  972    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  100 
 
 
505 aa  977    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  66.81 
 
 
494 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  69.03 
 
 
494 aa  519  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  59.65 
 
 
520 aa  501  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  50.87 
 
 
523 aa  489  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  53.78 
 
 
501 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  56.13 
 
 
500 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  52.06 
 
 
524 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  56.31 
 
 
499 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  56.29 
 
 
498 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  52.42 
 
 
542 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  55.79 
 
 
499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  52.2 
 
 
514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  51.15 
 
 
526 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  53.69 
 
 
502 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  50.8 
 
 
521 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  51.96 
 
 
496 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  46.7 
 
 
535 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  46 
 
 
549 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  45.01 
 
 
474 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  40.38 
 
 
422 aa  276  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  37.64 
 
 
422 aa  272  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  40.6 
 
 
423 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  38.22 
 
 
417 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  37.9 
 
 
422 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  40.6 
 
 
423 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  37.99 
 
 
417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  38.53 
 
 
397 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  38.53 
 
 
429 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  37.72 
 
 
429 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  37.72 
 
 
429 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  37.72 
 
 
429 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  37.72 
 
 
429 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  38.05 
 
 
411 aa  262  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  37.76 
 
 
429 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  37.96 
 
 
422 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  37.76 
 
 
429 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  37.99 
 
 
429 aa  259  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  37.41 
 
 
424 aa  259  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  38.93 
 
 
423 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  36.41 
 
 
433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  36.84 
 
 
419 aa  253  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  36.01 
 
 
419 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  37.96 
 
 
422 aa  251  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  35.6 
 
 
428 aa  249  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  36.36 
 
 
422 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  40.5 
 
 
422 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  41.41 
 
 
423 aa  246  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  37.7 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  37.33 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  37.04 
 
 
422 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  36.38 
 
 
431 aa  243  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  36 
 
 
402 aa  240  5e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  40.42 
 
 
418 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  34.52 
 
 
401 aa  236  6e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  40.43 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  35.85 
 
 
420 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  36.24 
 
 
402 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  36.7 
 
 
421 aa  229  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  37.91 
 
 
411 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  43.16 
 
 
416 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  42.7 
 
 
418 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  34.6 
 
 
417 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  34.6 
 
 
417 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  35.83 
 
 
429 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  36.38 
 
 
411 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  32.29 
 
 
461 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  37.67 
 
 
426 aa  195  1e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42057  PiT family transporter: phosphate  28.67 
 
 
538 aa  169  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.870144  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119536  high affinity phosphate transporter, probable  28.88 
 
 
600 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0681687  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  30.38 
 
 
514 aa  168  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  48.88 
 
 
535 aa  155  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  48.31 
 
 
535 aa  153  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  50.88 
 
 
599 aa  151  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  46.07 
 
 
535 aa  150  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  46.45 
 
 
516 aa  149  9e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  43.96 
 
 
506 aa  144  5e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  28.26 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  43.5 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  41.34 
 
 
522 aa  139  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  43.18 
 
 
508 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  43.18 
 
 
508 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  41.48 
 
 
508 aa  134  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  50.29 
 
 
539 aa  134  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0998  hypothetical protein  29.58 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.06049  normal  0.558836 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  47.8 
 
 
552 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  43.82 
 
 
521 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  32.47 
 
 
497 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  44.17 
 
 
346 aa  125  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1021  phosphate transporter  26.79 
 
 
391 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.335253 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66490  Na+/Pi symporter  36.91 
 
 
582 aa  118  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.602489  normal  0.0911162 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1038  phosphate transporter  28.81 
 
 
394 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11011  conserved hypothetical protein  36.41 
 
 
558 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677966 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1023  phosphate transporter  28.97 
 
 
401 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.880841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  27.25 
 
 
333 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  26.79 
 
 
332 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  25.49 
 
 
333 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  26.81 
 
 
333 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>