More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2009 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  99.68 
 
 		 308 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 308 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  95.77 
 
 		 328 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  85.39 
 
 		 308 aa  553  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  84.42 
 
 		 308 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  80.84 
 
 		 308 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  74.84 
 
 		 308 aa  474  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  60.98 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  60.98 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  59.54 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  60.33 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  59.67 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  59.34 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  60.33 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  58.36 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  60.33 
 
 		 304 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  58.69 
 
 		 313 aa  371  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  56.03 
 
 		 319 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  57.84 
 
 		 312 aa  368  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  57.38 
 
 		 314 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  57.84 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  58.17 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  58.69 
 
 		 302 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  58.36 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  59.02 
 
 		 305 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  58.69 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  58.69 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 		 310 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  55.7 
 
 		 316 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  53.92 
 
 		 310 aa  358  6e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 		 309 aa  348  9e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  55.41 
 
 		 331 aa  338  7e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  52.44 
 
 		 311 aa  335  5e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  52.43 
 
 		 307 aa  320  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 		 302 aa  301  7.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  46.1 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 298 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 304 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50.97 
 
 		 309 aa  295  8e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 300 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 		 303 aa  291  8e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  49.07 
 
 		 305 aa  290  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  49.49 
 
 		 306 aa  288  7e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  46.47 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 305 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 		 312 aa  285  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  46.05 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 		 312 aa  285  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 		 355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 		 309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  48.23 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  48.23 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 		 329 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  52.27 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  46.05 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 		 306 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 		 303 aa  278  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 		 306 aa  278  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  46.28 
 
 		 314 aa  276  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 		 307 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 		 316 aa  275  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 		 304 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  49.43 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  49.06 
 
 		 309 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  48.11 
 
 		 316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>