211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1838 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  98.97 
 
 
194 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  89.18 
 
 
194 aa  352  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  65.67 
 
 
201 aa  270  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  64.18 
 
 
201 aa  265  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  64.68 
 
 
201 aa  260  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  59.09 
 
 
220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  48.22 
 
 
203 aa  191  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  48.22 
 
 
203 aa  191  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  46.19 
 
 
203 aa  188  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  48 
 
 
201 aa  184  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  47.76 
 
 
212 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  45.23 
 
 
207 aa  178  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  50 
 
 
202 aa  178  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  46.97 
 
 
200 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  46.97 
 
 
216 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  47.98 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  46.7 
 
 
203 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.97 
 
 
203 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  44.72 
 
 
205 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  43.22 
 
 
205 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.44 
 
 
209 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  43.72 
 
 
205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  48.33 
 
 
206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  46.5 
 
 
202 aa  165  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  44 
 
 
209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  51.11 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  44.44 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  49.44 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  44 
 
 
209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  43.22 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  48.35 
 
 
221 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  48.35 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  43.15 
 
 
201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  45.56 
 
 
209 aa  161  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  42.21 
 
 
208 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  44.72 
 
 
230 aa  159  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  46.7 
 
 
208 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  46.7 
 
 
208 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  45.25 
 
 
207 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  44.16 
 
 
205 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  47.49 
 
 
207 aa  157  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  42 
 
 
208 aa  157  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  45.25 
 
 
207 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  45.69 
 
 
202 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  43.65 
 
 
210 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  46.15 
 
 
208 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  41.62 
 
 
201 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  41.62 
 
 
201 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  44.2 
 
 
209 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  44.2 
 
 
209 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  43.65 
 
 
209 aa  154  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  43.65 
 
 
208 aa  154  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  44.2 
 
 
209 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.2 
 
 
209 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  41.12 
 
 
201 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  44.2 
 
 
208 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  43.09 
 
 
208 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  43.65 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  48.33 
 
 
206 aa  150  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  43.94 
 
 
205 aa  150  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  44.72 
 
 
210 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  45.05 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  38.46 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  38.46 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  39.61 
 
 
229 aa  145  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  45.31 
 
 
201 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  40.29 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  39.9 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  41.79 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.07 
 
 
201 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  43.07 
 
 
201 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  40.2 
 
 
211 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  45.08 
 
 
208 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  41.67 
 
 
209 aa  140  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.45 
 
 
209 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  39.9 
 
 
209 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  43.1 
 
 
184 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  42.05 
 
 
209 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  33.99 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  42.22 
 
 
221 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  38.89 
 
 
200 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  40.78 
 
 
207 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  34.31 
 
 
218 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  51.18 
 
 
140 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  40.53 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.36 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  41.9 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.79 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  31.11 
 
 
203 aa  106  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.26 
 
 
206 aa  106  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.67 
 
 
197 aa  106  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  34.97 
 
 
201 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  33.88 
 
 
209 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  38.17 
 
 
216 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  33.15 
 
 
200 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.87 
 
 
217 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  35.83 
 
 
200 aa  101  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  31.69 
 
 
204 aa  97.8  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>