More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1808 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 357 aa  738    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  95.66 
 
 		 347 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  99.72 
 
 		 357 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.58 
 
 		 341 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.13 
 
 		 341 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.43 
 
 		 339 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.69 
 
 		 342 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.3 
 
 		 353 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.3 
 
 		 353 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.71 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.71 
 
 		 353 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.96 
 
 		 335 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.97 
 
 		 332 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.61 
 
 		 347 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.47 
 
 		 345 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.7 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.45 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.28 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.19 
 
 		 349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 355 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 355 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 		 355 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.48 
 
 		 348 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.1 
 
 		 355 aa  447  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.98 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.87 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.36 
 
 		 354 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 354 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.06 
 
 		 356 aa  433  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.4 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 333 aa  421  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.4 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.97 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 337 aa  309  5.9999999999999995e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 355 aa  306  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 328 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 330 aa  298  7e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 332 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 331 aa  296  5e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 335 aa  295  8e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 332 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 336 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 332 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 332 aa  291  9e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 332 aa  291  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  44.19 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 332 aa  286  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 347 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0246  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>