More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1797 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  100 
 
 		 108 aa  214  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 108 aa  214  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  97.75 
 
 		 109 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  72.53 
 
 		 94 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  60.95 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  71.03 
 
 		 105 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  60.55 
 
 		 113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  68.54 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  56.88 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  58.49 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  55.96 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  65.91 
 
 		 110 aa  123  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  57.94 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  54.21 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  55.96 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  54.21 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  49.09 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  52.68 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  49.56 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  54.63 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  55.14 
 
 		 146 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  49.5 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  54.21 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  50.55 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  54.17 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  50.93 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  48.04 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  49.09 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  48.04 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  49.55 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  50.49 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  50.56 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  50.56 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  52.25 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  50.89 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  55.95 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  48.48 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  49.41 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  51.46 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  43.14 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  49.44 
 
 		 108 aa  95.9  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  52.27 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  45.63 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  45.88 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  50.51 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  49.41 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  50.52 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  53.09 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  56.1 
 
 		 178 aa  93.6  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  48.35 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  54.32 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  51.46 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  53.09 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  56.79 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  52.44 
 
 		 111 aa  92  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  51.46 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  50.63 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  42.39 
 
 		 125 aa  90.5  6e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  48.35 
 
 		 113 aa  90.9  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  51.16 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  49.04 
 
 		 112 aa  90.1  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  47.57 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  48.45 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  49.41 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  45.88 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  39.83 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  50.62 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  49.44 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  55 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  48.78 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  49.43 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  48.81 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  42.7 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  51.19 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  42.16 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  48.78 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  50.67 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>