More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1793 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1793  single-strand DNA binding protein  100 
 
 		 173 aa  344  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.147298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0439  single-strand binding protein  98.84 
 
 		 173 aa  341  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  86.13 
 
 		 162 aa  291  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  70.17 
 
 		 168 aa  239  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  62.43 
 
 		 170 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1816  single-strand binding protein  78.05 
 
 		 132 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0697852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  63.22 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  80.34 
 
 		 159 aa  201  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3806  single-strand binding protein  79.49 
 
 		 170 aa  199  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1425  single-strand binding protein  82.46 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.195653  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  60.69 
 
 		 158 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1885  single-strand binding protein  79.82 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110656  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0736  single-stranded DNA-binding protein  52.49 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0217627  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  61.27 
 
 		 160 aa  192  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  58.19 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  61.27 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  60.12 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  61.27 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  64.74 
 
 		 172 aa  187  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2452  single-strand binding protein  75.44 
 
 		 195 aa  186  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  58.29 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  59.2 
 
 		 163 aa  185  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1537  single-strand binding protein  57.8 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  75.44 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2200  single-strand binding protein  61.2 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338329  normal  0.513026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  60.12 
 
 		 167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  58.96 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1236  single-stranded DNA-binding protein  57.39 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  60.12 
 
 		 167 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  61.27 
 
 		 169 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2243  single-strand binding protein  72.81 
 
 		 189 aa  180  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.735655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2518  single-strand binding protein  72.81 
 
 		 189 aa  180  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  60.69 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2879  single-strand binding protein  60.12 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.561804  normal  0.0379705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2198  single-strand binding protein  54.6 
 
 		 151 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00537344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4316  single-strand binding protein  71.05 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  67.18 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  71.05 
 
 		 169 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  70.49 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  52.54 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2848  single-strand binding protein  69.3 
 
 		 183 aa  167  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0204  single-strand binding protein  63.25 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0539  single-strand binding protein  50 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0171971  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3622  single-strand binding protein  65.79 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0622849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  69.3 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2038  single-strand binding protein  52.02 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  57.06 
 
 		 171 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3047  single-stranded DNA-binding protein  64.04 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  65.52 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6613  single-stranded DNA-binding protein  46.82 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  48.57 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2069  single-strand binding protein  49.44 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  64.6 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  49.12 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  56.25 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  56.25 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  56.25 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  56.25 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  56.25 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  56.25 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  56.25 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  56.25 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  65.45 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  43.1 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  49.11 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  53.33 
 
 		 236 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  53.33 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  53.33 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  53.33 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  53.33 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  61.54 
 
 		 201 aa  148  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  45.7 
 
 		 219 aa  148  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0815  single-strand binding protein  52.89 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  66.36 
 
 		 182 aa  147  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  68 
 
 		 180 aa  147  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  57.58 
 
 		 238 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  48.89 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0759  single-strand binding protein  46.43 
 
 		 151 aa  146  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  58.4 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  45.98 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  67.35 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  57.89 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  63.16 
 
 		 180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  68 
 
 		 182 aa  144  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  68 
 
 		 182 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  68 
 
 		 182 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  46.51 
 
 		 182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  47.31 
 
 		 190 aa  144  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0266  single-strand binding protein  53.51 
 
 		 157 aa  144  9e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  41.99 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  58.47 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  51.15 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  56.06 
 
 		 175 aa  141  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  45.03 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  56.78 
 
 		 231 aa  140  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  65 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  63.37 
 
 		 181 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  64 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  58.82 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>