208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1784 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  99.19 
 
 		 124 aa  240  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  68.85 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  41.07 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  44.76 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 1111 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  39.83 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  39.83 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.9 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  40.68 
 
 		 1096 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 631 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  41.67 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  44.04 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  39.83 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  36.7 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 602 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 1096 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1774  response regulator receiver  37.04 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0498529  decreased coverage  0.00379005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 559 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 639 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  48.65 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  33.65 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  40.35 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.36 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  38 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2866  response regulator receiver  39.13 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  33.64 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  41.24 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6551  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.36 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3092  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0555687  normal  0.395265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  34.15 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  37.37 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  46.3 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.45 
 
 		 846 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4303  putative two-component response regulator protein  38.2 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  36.45 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.28 
 
 		 847 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  30.56 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  36.28 
 
 		 847 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  31.82 
 
 		 844 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.79 
 
 		 849 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1262  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  33.03 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.61 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.61 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2922  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  36.75 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.61 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  39.53 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  34.78 
 
 		 847 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.58 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  33.03 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.94 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  35.8 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.11 
 
 		 844 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>