56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1645 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  100 
 
 		 444 aa  868    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  96.69 
 
 		 393 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  40.81 
 
 		 490 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  41.5 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  32.65 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  32.73 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  28.57 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  28.52 
 
 		 472 aa  94.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0618  hypothetical protein  87.5 
 
 		 60 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  23.28 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  27.03 
 
 		 781 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  29.43 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2586  hypothetical protein  60.61 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  23.82 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  23.83 
 
 		 659 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  23.76 
 
 		 649 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  26.52 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  26.18 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  25.17 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  30.68 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  24.58 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  28.8 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  28.8 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  26.64 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  28.4 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  28.27 
 
 		 624 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  23.21 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  27.35 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  27.27 
 
 		 405 aa  57  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  26.82 
 
 		 420 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  26.1 
 
 		 399 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  26.5 
 
 		 368 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  26.4 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  26.4 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  26.54 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  23.08 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  26.62 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  25.29 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  25.89 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  24.94 
 
 		 645 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  24.94 
 
 		 645 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  24.94 
 
 		 645 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  25.74 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  27.78 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  24.86 
 
 		 315 aa  46.6  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  25.9 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  25.2 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  31.21 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  23.75 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4002  phage major capsid protein, HK97 family  26.77 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  26.97 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  24.62 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  25.25 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  23.88 
 
 		 646 aa  43.5  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  24.06 
 
 		 386 aa  43.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  23.51 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>