More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1585 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0237  putative CheW protein  100 
 
 
163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1585  chemotaxis protein, CheW2  100 
 
 
163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  82.82 
 
 
163 aa  271  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  39.42 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  38.69 
 
 
189 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  38.46 
 
 
156 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  38.82 
 
 
175 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  37.41 
 
 
156 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  35.42 
 
 
170 aa  100  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  37.5 
 
 
170 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  37.33 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  34.04 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  34.27 
 
 
155 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  34.78 
 
 
169 aa  98.2  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  37.32 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  32.87 
 
 
163 aa  95.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  32.61 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  34.06 
 
 
164 aa  94  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.25 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  40.14 
 
 
194 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  40.14 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  39.46 
 
 
194 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.14 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  34.27 
 
 
179 aa  91.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  33.8 
 
 
179 aa  91.3  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  41.01 
 
 
185 aa  90.9  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 
164 aa  90.5  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  33.8 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  29.05 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  32.19 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  32.87 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.43 
 
 
164 aa  87.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  31.76 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  29.45 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  30.94 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  34.51 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  32.17 
 
 
162 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  28.66 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  28.77 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  33.57 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  33.55 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  33.57 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  33.55 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  33.33 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  32.65 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  29.73 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  33.33 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  35.17 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  36.88 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  32.64 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  27.59 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  26.39 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  25.68 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  28.17 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  29.94 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  29.94 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  30.99 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  32.19 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  34.04 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  27.14 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  33.86 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  33.86 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  32.41 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  25.87 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  30.15 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  38.58 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  30.99 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  26.62 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  25.17 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  32.86 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  28.35 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  38.1 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.57 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  27.56 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.33 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.67 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  29.08 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.67 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.67 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.67 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  31.94 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  28.67 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  28.67 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  28.67 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  30.5 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  27.56 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  38.1 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  28.67 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  30.22 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28.47 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  31.72 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  25.69 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  31.72 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  31.62 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  30 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  28.57 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  28.57 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  29.93 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>