93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1497 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  90.09 
 
 		 212 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  64.14 
 
 		 198 aa  262  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  55.61 
 
 		 203 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  60.95 
 
 		 198 aa  211  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  50.26 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.29 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.53 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.8 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.93 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.93 
 
 		 302 aa  101  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.72 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  34.38 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.51 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.76 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.57 
 
 		 227 aa  99  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.57 
 
 		 258 aa  98.6  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.2 
 
 		 332 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.75 
 
 		 315 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.75 
 
 		 315 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.66 
 
 		 339 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.12 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.54 
 
 		 314 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.16 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.59 
 
 		 313 aa  92  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  32.37 
 
 		 257 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.76 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.14 
 
 		 268 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.29 
 
 		 317 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.71 
 
 		 315 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.54 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.86 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  29.8 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.53 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.29 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.18 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  32.42 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  31.87 
 
 		 258 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.98 
 
 		 313 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.93 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.23 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.48 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  25.48 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.75 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.14 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  26.32 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.38 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.38 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  27.06 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.63 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.89 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.71 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  26.32 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.41 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  34.09 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  34.09 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2599  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.95 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.59 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  21.25 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.78 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.36 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.68 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.37 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  18.87 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.48 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.19 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.9 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.39 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3381  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.27 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.23519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.27 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72131  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2340  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.27 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.46 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3608  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.04 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.53 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4003  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.53 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0440839  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.44 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.44 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.27 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0686  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0706  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.33 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  22.44 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.51 
 
 		 273 aa  45.1  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0795  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.16 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1830  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.27 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.61 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0814  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.03 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000179338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.98 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.17 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  23.04 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.46 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>