More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1470 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  99.53 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  90.57 
 
 		 212 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  65.07 
 
 		 210 aa  258  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  64.39 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  62.93 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  60.11 
 
 		 199 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  56.28 
 
 		 269 aa  199  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  55.94 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  55.17 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  58.1 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  53.33 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  50.5 
 
 		 198 aa  184  9e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  53.85 
 
 		 267 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  58.7 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  58.7 
 
 		 207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  57.61 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  58.43 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  55.49 
 
 		 198 aa  181  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  57.14 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  51.46 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  50 
 
 		 292 aa  178  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  55.03 
 
 		 202 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  57.51 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  57.07 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  54.84 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  54.27 
 
 		 258 aa  175  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  55.98 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  59.56 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  52.71 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  58.01 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  53.55 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  53.55 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  59.34 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  59.34 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  59.34 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  53.5 
 
 		 208 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  59.56 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  59.34 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  59.34 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  58.56 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  59.56 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  55.25 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  57.07 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  58.56 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  55.43 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  58.56 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  55.8 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  55.43 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  55.43 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  55.14 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  52.43 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  51.56 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  56.59 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  54.35 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  54.89 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  51.23 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  57.46 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  46 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  54.89 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  50.76 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 211 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  51.32 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  49.06 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  49.25 
 
 		 268 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  56.67 
 
 		 240 aa  168  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  53.19 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 197 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  57.61 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  57.61 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  54.05 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  44.9 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  52.11 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  53.65 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1208  ribonuclease HII  52.48 
 
 		 298 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.621532 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  46.94 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  53.51 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  53.12 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  55.43 
 
 		 249 aa  165  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  51.76 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4361  ribonuclease HII  50 
 
 		 266 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  0.0104654 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1266  ribonuclease HII  55.1 
 
 		 249 aa  164  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  45.97 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  52.36 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  47.67 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1226  ribonuclease HII  50 
 
 		 281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  53.26 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>