More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1390 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  100 
 
 		 293 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  99.66 
 
 		 293 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  93.17 
 
 		 293 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.28 
 
 		 288 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  66.32 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  57.73 
 
 		 306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  62.15 
 
 		 289 aa  305  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  39.56 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  35.74 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.29 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  30.32 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  31.9 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  31.39 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  33.21 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.47 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  27.63 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  28.88 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.28 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  30.8 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  27.55 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  23.57 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  27.05 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  27.05 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  27.05 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  27.05 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  27.05 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  27.05 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  27.05 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  23.53 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  23.53 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  23.53 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  23.53 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  23.53 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  23.3 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.21 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.51 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  32.88 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.21 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  30.28 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  26.64 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  26.64 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  23.93 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  26.26 
 
 		 414 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  31.52 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  28.72 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  29.24 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  31.8 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  26.36 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  26.38 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  26.38 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  30.41 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  26.24 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.71 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  33.21 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  28.94 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  28.33 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  26.44 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  28.26 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  25.98 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.97 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  28.36 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  25.42 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  29.24 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.14 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  33.03 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.11 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  30.7 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  28.31 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.16 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  21.6 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  24.45 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  25.08 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.5 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  25.83 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  27.3 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  31.75 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  31.75 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25.36 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.31 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  21.25 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  32.6 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  25.46 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>