258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1373 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  741    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  98.97 
 
 		 390 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  87.69 
 
 		 390 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  57.22 
 
 		 389 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  53.32 
 
 		 397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 417 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  33.78 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 417 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 407 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 425 aa  133  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 415 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  34.17 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.34 
 
 		 414 aa  122  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  30.62 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 395 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 425 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  32.68 
 
 		 450 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 436 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 434 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  29.21 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  34.3 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  31.3 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 412 aa  99.8  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  32.06 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  32.06 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  32.06 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  32.06 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  32.06 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 415 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  32.06 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  32.06 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  26.78 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 421 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 416 aa  89.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 371 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  30.79 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  29.38 
 
 		 420 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4386  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  29.1 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  23.56 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  29.74 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  24 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  23.73 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  24.29 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  24.46 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  25.43 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.12 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  24.47 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  24.62 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  24.03 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  23.76 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  24.34 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  26.44 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>