More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1372 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  810    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  93.45 
 
 		 433 aa  764    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  99.76 
 
 		 412 aa  808    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  73.82 
 
 		 412 aa  618  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  74.31 
 
 		 414 aa  612  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  67.48 
 
 		 415 aa  560  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  65.42 
 
 		 421 aa  551  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  67.83 
 
 		 411 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 412 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 417 aa  318  9e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  42.29 
 
 		 414 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  41.35 
 
 		 407 aa  310  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 412 aa  305  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 406 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  42.21 
 
 		 405 aa  296  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 436 aa  288  9e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  41.71 
 
 		 430 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 425 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  39.49 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  39.12 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 402 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  38.5 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  40.8 
 
 		 402 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 400 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 405 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  38.42 
 
 		 405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 400 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 411 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 410 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  38.97 
 
 		 528 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  41 
 
 		 480 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  39.11 
 
 		 399 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  39.36 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 		 416 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 410 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  38.86 
 
 		 399 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 408 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  38.02 
 
 		 417 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  38.02 
 
 		 417 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  38.02 
 
 		 417 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  38.02 
 
 		 417 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  38.02 
 
 		 417 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  38.02 
 
 		 417 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  37.94 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 409 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 389 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  34.26 
 
 		 421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  34.87 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.88 
 
 		 429 aa  116  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.69 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.87 
 
 		 452 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 422 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  29.01 
 
 		 430 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  29.53 
 
 		 425 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  26.97 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>