121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1362 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  100 
 
 		 456 aa  870    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  98.68 
 
 		 456 aa  858    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  84.87 
 
 		 456 aa  700    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  66.44 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  58.46 
 
 		 443 aa  500  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  58.85 
 
 		 460 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  53.86 
 
 		 454 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  45.53 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  48.7 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  45.49 
 
 		 462 aa  359  5e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 		 465 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  46.24 
 
 		 466 aa  336  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 467 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 465 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  38.44 
 
 		 455 aa  286  7e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 493 aa  280  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 462 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 		 462 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  36.49 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  32.52 
 
 		 435 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  32.3 
 
 		 460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  31.98 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  31.6 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 426 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 429 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 419 aa  154  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 428 aa  153  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  29.16 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  30.97 
 
 		 449 aa  147  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  30.92 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  28.36 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 460 aa  133  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  30.93 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  29.3 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  25.27 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  25.05 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 427 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  25.49 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  25.49 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  25.49 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  25.49 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  25.6 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  25.49 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  25.27 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 454 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  30.98 
 
 		 454 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 454 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  25.34 
 
 		 408 aa  106  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 447 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  27.6 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 436 aa  97.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  27.93 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26.41 
 
 		 474 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  25.13 
 
 		 425 aa  94  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  27.79 
 
 		 440 aa  93.6  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 404 aa  91.3  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  25 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  26.41 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  29.19 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 469 aa  87  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 450 aa  86.7  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  22.92 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  21.38 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  25.73 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 572 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  27.07 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>