More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1357 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  86.49 
 
 
868 aa  1368    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1357  cytoplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
849 aa  1691    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0025  histidine kinase  99.18 
 
 
849 aa  1677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  50 
 
 
761 aa  613  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  50.7 
 
 
819 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
1603 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.84 
 
 
770 aa  415  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
1131 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 
1069 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 
1369 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
1126 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 
1118 aa  365  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 
916 aa  355  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0265  histidine kinase  50 
 
 
716 aa  355  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 
1398 aa  353  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  40.64 
 
 
1135 aa  346  8.999999999999999e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
1258 aa  345  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 
946 aa  342  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  40.19 
 
 
1014 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  39.46 
 
 
1179 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 
1169 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 
1363 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  42.64 
 
 
1177 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
977 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
1820 aa  337  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  40.99 
 
 
1346 aa  336  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 
833 aa  335  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
1040 aa  335  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 
1310 aa  334  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
812 aa  333  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
1240 aa  332  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 
921 aa  331  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
1305 aa  331  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
1202 aa  330  9e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
1309 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 
1255 aa  326  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 
957 aa  326  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
1550 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
835 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  38.72 
 
 
1407 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 
816 aa  325  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 
1397 aa  325  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
1340 aa  325  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
758 aa  324  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 
682 aa  324  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
1064 aa  323  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.92 
 
 
1763 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1326 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
1767 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
1266 aa  321  3.9999999999999996e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.06 
 
 
1331 aa  321  3.9999999999999996e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1165 aa  320  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.05 
 
 
818 aa  320  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
1768 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
1128 aa  320  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.84 
 
 
835 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 
1611 aa  319  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 
1560 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.57 
 
 
873 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1767 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
1287 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  37.94 
 
 
1214 aa  318  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 
818 aa  318  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
1582 aa  317  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
1193 aa  317  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
929 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  36.26 
 
 
786 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
784 aa  314  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
981 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  41.31 
 
 
847 aa  313  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
876 aa  313  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.89 
 
 
923 aa  313  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  39.63 
 
 
1322 aa  313  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  36.52 
 
 
2035 aa  312  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
801 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.33 
 
 
1442 aa  311  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  41.02 
 
 
1417 aa  311  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
1267 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
1767 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
1771 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
1072 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
887 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
1788 aa  309  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
1765 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
1622 aa  308  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
1033 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
1480 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
1240 aa  307  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
927 aa  306  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
917 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1384 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 
1333 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
919 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  41.73 
 
 
1418 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
1234 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  39.08 
 
 
905 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
936 aa  305  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.01 
 
 
852 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 
1245 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 
1374 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>