296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1350 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  97.25 
 
 		 291 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  92.07 
 
 		 291 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  75.44 
 
 		 292 aa  417  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  71.72 
 
 		 291 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  63.67 
 
 		 291 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  60.14 
 
 		 291 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  53.92 
 
 		 295 aa  295  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  56.29 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  55.24 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  53.85 
 
 		 296 aa  285  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  53.92 
 
 		 297 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  55.48 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  53.63 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  53.4 
 
 		 298 aa  278  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  53.85 
 
 		 299 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  53.85 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  52.17 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  53.85 
 
 		 295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  55.94 
 
 		 296 aa  272  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  51.88 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  54.58 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  53.74 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  53.72 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  53.38 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  53.9 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  62.5 
 
 		 226 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  52.88 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  54.76 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  58.85 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  51.56 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  59.65 
 
 		 241 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 		 299 aa  244  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  50.17 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  50.17 
 
 		 297 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  48.62 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  45.45 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  49.03 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  43.89 
 
 		 432 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  43.62 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  46.01 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  45.45 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  45.65 
 
 		 419 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  44.59 
 
 		 403 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  38.38 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  46.93 
 
 		 429 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  50.71 
 
 		 297 aa  175  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  42.59 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  41.35 
 
 		 285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  46.76 
 
 		 419 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  39.86 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  39.58 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  45.45 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  44.78 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  45.91 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  43.16 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  43.5 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  42.56 
 
 		 406 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  43.05 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  43.22 
 
 		 316 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  43.22 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  42.8 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  42.8 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  42.2 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  42.8 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  42.8 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  41.5 
 
 		 410 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  47.12 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  40.23 
 
 		 429 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  40.23 
 
 		 404 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  41.8 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  46.53 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  42.41 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  41.39 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  43.18 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  44.55 
 
 		 372 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  38.3 
 
 		 404 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  42.73 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  43.75 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  44.55 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  44.44 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  42.73 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  42.48 
 
 		 421 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  42.73 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  46.63 
 
 		 235 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  44.71 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  45.1 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  44.44 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  40.68 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  40.68 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  40.68 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  40.68 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  45.67 
 
 		 237 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  40.68 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  42.54 
 
 		 398 aa  162  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  39.1 
 
 		 415 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  40.5 
 
 		 407 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  43.84 
 
 		 454 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>