More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1219 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  98.92 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  96.77 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  73.51 
 
 		 187 aa  241  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  71.6 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  63.04 
 
 		 188 aa  231  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  70.67 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  49.66 
 
 		 213 aa  148  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  48.43 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  47.8 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.41 
 
 		 217 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  48.32 
 
 		 204 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  44.32 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  48.99 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.82 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  45.76 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  43.33 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.9 
 
 		 207 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  42.49 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  42.33 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.94 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  45.86 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.31 
 
 		 202 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  47.26 
 
 		 202 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  47.77 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  44.81 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  44.38 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  44.16 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  44.08 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  44.03 
 
 		 230 aa  121  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  44.03 
 
 		 230 aa  121  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  41.45 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  40.86 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  38.86 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  38.66 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  40.94 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  39.06 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  44.53 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  40.78 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  40.78 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  42.86 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  40.22 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 209 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  41.11 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  37.57 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  38.29 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  40.22 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  41.45 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  39.33 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  40.52 
 
 		 181 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 		 199 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 		 189 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  41.94 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  40.71 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  38.1 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  39.58 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  36 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0401  GrpE protein  38.25 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  40.27 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  36.79 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  37.36 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  38.89 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  38.97 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  39.42 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  39.07 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  35.26 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  42.17 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.08 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  39.31 
 
 		 244 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  37.13 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  35.1 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  39.74 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  34.44 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  35.77 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  34.87 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  33.33 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  37.13 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  37.13 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  37.13 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  37.13 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  37.13 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.76 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>