More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1218 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  58.76 
 
 		 921 aa  894    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  52.54 
 
 		 914 aa  861    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  50.84 
 
 		 904 aa  783    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  44.38 
 
 		 820 aa  724    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  56.84 
 
 		 910 aa  927    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  56.24 
 
 		 910 aa  921    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  55.16 
 
 		 905 aa  779    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  56.71 
 
 		 910 aa  919    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  51.83 
 
 		 904 aa  766    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  91.89 
 
 		 876 aa  1521    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  73.17 
 
 		 878 aa  1247    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  54.06 
 
 		 916 aa  825    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 		 804 aa  725    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  56.68 
 
 		 915 aa  883    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  58.09 
 
 		 888 aa  948    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 875 aa  1746    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  57.9 
 
 		 908 aa  917    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  51.12 
 
 		 919 aa  793    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  54.01 
 
 		 896 aa  822    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  56.82 
 
 		 898 aa  919    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  48.82 
 
 		 873 aa  672    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  57.56 
 
 		 929 aa  900    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  57.87 
 
 		 911 aa  941    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  51.72 
 
 		 858 aa  786    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  43.5 
 
 		 804 aa  719    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  69.6 
 
 		 877 aa  1169    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  57.4 
 
 		 882 aa  935    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  55.82 
 
 		 883 aa  916    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  57.18 
 
 		 880 aa  910    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  54.67 
 
 		 962 aa  809    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  70.86 
 
 		 877 aa  1189    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  57.1 
 
 		 923 aa  932    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  56.9 
 
 		 907 aa  949    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  58.44 
 
 		 908 aa  929    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  69.87 
 
 		 879 aa  1175    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  50.98 
 
 		 864 aa  757    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 		 872 aa  656    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  57.14 
 
 		 881 aa  913    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  99.54 
 
 		 880 aa  1737    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 		 869 aa  637    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  54.35 
 
 		 916 aa  828    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  52.92 
 
 		 925 aa  796    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  55.22 
 
 		 929 aa  818    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  53.09 
 
 		 897 aa  843    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  57.72 
 
 		 907 aa  941    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  45.96 
 
 		 868 aa  668    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.26 
 
 		 871 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 		 870 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  45.73 
 
 		 882 aa  623  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 		 872 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  42.34 
 
 		 863 aa  622  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.68 
 
 		 869 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 873 aa  618  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  44.44 
 
 		 859 aa  616  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 		 863 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 		 870 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.95 
 
 		 859 aa  615  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 932 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 		 874 aa  611  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 857 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 		 856 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 		 856 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 		 870 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  40.98 
 
 		 855 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 		 854 aa  612  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  44.72 
 
 		 878 aa  612  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 857 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 855 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 		 859 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 855 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 		 880 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  41.17 
 
 		 853 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  41.8 
 
 		 872 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 855 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 891 aa  608  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  45.87 
 
 		 862 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 861 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  42.55 
 
 		 853 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  42.7 
 
 		 855 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  42.55 
 
 		 853 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 		 856 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  42.05 
 
 		 851 aa  605  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 		 857 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 		 856 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 		 855 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 		 855 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 		 862 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 855 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 		 882 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 860 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 861 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 861 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 		 855 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.19 
 
 		 855 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  42.43 
 
 		 853 aa  601  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 856 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 		 856 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  40.71 
 
 		 853 aa  602  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 		 887 aa  601  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.14 
 
 		 889 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>