More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1210 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  100 
 
 		 400 aa  785    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  98.5 
 
 		 418 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  74.5 
 
 		 418 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  49.13 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  46.23 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  45.11 
 
 		 426 aa  346  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  48.12 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  30.98 
 
 		 415 aa  207  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.92 
 
 		 400 aa  206  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  38.51 
 
 		 391 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  34.49 
 
 		 397 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.69 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.1 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28 
 
 		 470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  31.44 
 
 		 560 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.75 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1702  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.75 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.22 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  30.62 
 
 		 396 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.48 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.6 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.35 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.14 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.71 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  27.11 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.35 
 
 		 602 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.98 
 
 		 526 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  29.19 
 
 		 574 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  31.22 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.33 
 
 		 389 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.07 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.27 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  30.08 
 
 		 568 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.79 
 
 		 566 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.26 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  30.03 
 
 		 571 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 562 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  29.27 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  29.4 
 
 		 563 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  30.03 
 
 		 571 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 564 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  30.58 
 
 		 568 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  29.66 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.04 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  28.37 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.53 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  36.46 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  24.56 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  28.77 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  29.05 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.53 
 
 		 941 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  30.53 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  30.53 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 563 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  28.75 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  24.94 
 
 		 575 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.48 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.94 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 563 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.17 
 
 		 486 aa  106  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.89 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  29.75 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  29.36 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  28.34 
 
 		 575 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.68 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  30.18 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  24.75 
 
 		 577 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  29.86 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.78 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  29.72 
 
 		 394 aa  103  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1615  response regulator receiver protein  44.72 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000138875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  25.5 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  25.5 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  25.86 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.92 
 
 		 572 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  28.29 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0308  putative response regulator  24.3 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  25.21 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1706  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.96 
 
 		 324 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  25.21 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2000  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000423497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  42.15 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  25.21 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.46 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  27.64 
 
 		 567 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.65 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  25.21 
 
 		 380 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  23.7 
 
 		 568 aa  99.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  34.38 
 
 		 301 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  25.21 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  24.25 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  33.6 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2693  diguanylate cyclase  39.67 
 
 		 302 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  24.86 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  27.01 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  33.5 
 
 		 337 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>