More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1162 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  99.51 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  91.18 
 
 		 204 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  70.65 
 
 		 203 aa  277  7e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  69.08 
 
 		 206 aa  275  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  72.19 
 
 		 196 aa  275  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  69.15 
 
 		 194 aa  271  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  51.76 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  47.98 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  46.86 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  47.7 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  47.7 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  47.09 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  46.29 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  48.24 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  43.88 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  46.89 
 
 		 251 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  46.89 
 
 		 251 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  42.08 
 
 		 238 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  45.5 
 
 		 255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  45.61 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  42.22 
 
 		 201 aa  151  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  45.45 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  45.03 
 
 		 257 aa  147  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  42.86 
 
 		 286 aa  147  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  42.44 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  42.5 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  47.9 
 
 		 279 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  45.86 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  42.2 
 
 		 262 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  42.11 
 
 		 263 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  46.56 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  48.5 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  47.4 
 
 		 260 aa  141  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  42.69 
 
 		 259 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  39.78 
 
 		 314 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  42.04 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  43.72 
 
 		 225 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  46.88 
 
 		 181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  43.48 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  39.55 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  41.5 
 
 		 150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  44.53 
 
 		 153 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  43.7 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  39.71 
 
 		 152 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  42.34 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  38.97 
 
 		 152 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  40.88 
 
 		 151 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  40.74 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  41.61 
 
 		 153 aa  108  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  44.53 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  40.15 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  40.15 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  40.3 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  40.3 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  40.3 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  40.3 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  40.3 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  40.3 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  39.42 
 
 		 151 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  42.04 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  38.97 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  38.69 
 
 		 154 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  39.87 
 
 		 159 aa  104  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  38.69 
 
 		 154 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  37.96 
 
 		 154 aa  104  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  38.81 
 
 		 150 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  38.81 
 
 		 150 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  38.81 
 
 		 150 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  41.6 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  37.16 
 
 		 158 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  38.06 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  38.06 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  38.06 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  39.71 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  42.4 
 
 		 140 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  42.06 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  38.1 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  43.31 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  45.22 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  45.22 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  101  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  37.86 
 
 		 151 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  41.3 
 
 		 152 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  36.57 
 
 		 150 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  39.53 
 
 		 151 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  44.35 
 
 		 152 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  38.41 
 
 		 151 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  44.35 
 
 		 169 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  38.46 
 
 		 165 aa  99.4  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  37.68 
 
 		 165 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  33.56 
 
 		 159 aa  98.6  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  38.17 
 
 		 154 aa  98.2  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  39.47 
 
 		 153 aa  98.2  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  41.74 
 
 		 158 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  34.31 
 
 		 151 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>