More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1156 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  94.47 
 
 
253 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  80.83 
 
 
244 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  77.6 
 
 
252 aa  390  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  77.82 
 
 
254 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  75.51 
 
 
249 aa  380  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  66.81 
 
 
263 aa  332  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  68.07 
 
 
288 aa  332  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  64 
 
 
264 aa  322  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  65.13 
 
 
267 aa  315  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  62.34 
 
 
310 aa  314  1e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  62.08 
 
 
271 aa  312  3e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  64.56 
 
 
311 aa  312  4e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  61.76 
 
 
258 aa  310  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  64.26 
 
 
321 aa  307  9e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  61.34 
 
 
267 aa  305  6e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  62.4 
 
 
282 aa  304  1e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  62.4 
 
 
289 aa  303  3e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  61.73 
 
 
270 aa  302  4e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  62.7 
 
 
282 aa  301  5e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  61.57 
 
 
289 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  60.48 
 
 
290 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  61.98 
 
 
283 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  62.66 
 
 
279 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  62.66 
 
 
277 aa  297  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  62.66 
 
 
254 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  61.09 
 
 
316 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  61.8 
 
 
258 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  61.8 
 
 
258 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  55.2 
 
 
256 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.94 
 
 
268 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  61.6 
 
 
333 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  61.18 
 
 
317 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  60.41 
 
 
332 aa  293  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  59.57 
 
 
254 aa  292  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  59.66 
 
 
245 aa  292  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  58.51 
 
 
253 aa  293  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  60.76 
 
 
314 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  60.78 
 
 
264 aa  292  4e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  58.4 
 
 
243 aa  291  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  56.72 
 
 
243 aa  291  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  9.37515e-06 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.76 
 
 
336 aa  291  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  56.72 
 
 
243 aa  290  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  57.98 
 
 
241 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  58.58 
 
 
240 aa  289  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  60.34 
 
 
317 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  58.4 
 
 
241 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  60.52 
 
 
261 aa  289  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.4 
 
 
241 aa  288  5e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  58.4 
 
 
241 aa  288  5e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 
241 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 
241 aa  288  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  57.26 
 
 
255 aa  287  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  59.43 
 
 
262 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  58.4 
 
 
241 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  58.4 
 
 
241 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  56.72 
 
 
241 aa  287  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  57.56 
 
 
241 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  57.98 
 
 
241 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  56.49 
 
 
240 aa  286  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  55.23 
 
 
244 aa  286  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  56.72 
 
 
241 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  54.43 
 
 
246 aa  286  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  59.13 
 
 
244 aa  286  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  59.51 
 
 
262 aa  285  3e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  57.14 
 
 
241 aa  284  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  59.02 
 
 
263 aa  284  1e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  57.79 
 
 
262 aa  283  2e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  57.79 
 
 
262 aa  283  2e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.56 
 
 
241 aa  283  2e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  282  3e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  59.67 
 
 
263 aa  282  4e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  55.29 
 
 
255 aa  282  4e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  56.49 
 
 
268 aa  282  4e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 
261 aa  282  4e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  58.2 
 
 
266 aa  281  5e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  56.3 
 
 
241 aa  281  5e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  59.2 
 
 
264 aa  281  5e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  58.58 
 
 
244 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  55.13 
 
 
246 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  56.96 
 
 
246 aa  280  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.82009e-07 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  59.83 
 
 
239 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  56.73 
 
 
261 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  55.6 
 
 
244 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  56.49 
 
 
241 aa  278  5e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  57.14 
 
 
258 aa  278  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  55.46 
 
 
241 aa  278  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  57.14 
 
 
258 aa  278  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  57.87 
 
 
249 aa  278  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  54.01 
 
 
246 aa  278  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  57.96 
 
 
264 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  56.73 
 
 
258 aa  277  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  61.6 
 
 
241 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  56.73 
 
 
258 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  61.6 
 
 
241 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  56.6 
 
 
243 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 
258 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 
258 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 
258 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>