More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1038 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
247 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
261 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  97.98 
 
 
261 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  64.37 
 
 
248 aa  311  9e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  59.44 
 
 
282 aa  299  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  65.85 
 
 
248 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  60.32 
 
 
267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  44.09 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  49.3 
 
 
241 aa  199  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  47.98 
 
 
248 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  45.33 
 
 
249 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  46.19 
 
 
248 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  43.88 
 
 
250 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  45.33 
 
 
250 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  39.77 
 
 
258 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  44.84 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  45.95 
 
 
251 aa  187  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  44.84 
 
 
247 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  42.41 
 
 
243 aa  186  3e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  44.49 
 
 
250 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  44.39 
 
 
249 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  44.39 
 
 
247 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  39.43 
 
 
243 aa  185  6e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  43.36 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  44.25 
 
 
249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  44 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  43.61 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  43.67 
 
 
250 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  40.33 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  44.49 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  43.23 
 
 
249 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  43.61 
 
 
250 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  43.23 
 
 
249 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  43.69 
 
 
251 aa  175  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  42.79 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  40.37 
 
 
241 aa  172  5e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  39.84 
 
 
257 aa  171  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  39.63 
 
 
243 aa  166  4e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  42.47 
 
 
268 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  41.89 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  43.33 
 
 
260 aa  161  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  40.54 
 
 
251 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  40.54 
 
 
251 aa  158  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  40.54 
 
 
251 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  41.92 
 
 
261 aa  151  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  46.15 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  37.26 
 
 
261 aa  148  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  38.03 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  34.05 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  36.11 
 
 
284 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  31.58 
 
 
373 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  33.65 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  35.87 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  38.12 
 
 
266 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  34.29 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  35.57 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  34.29 
 
 
229 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  32.92 
 
 
265 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  29.69 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  33.79 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  34.54 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  33.48 
 
 
258 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  35.24 
 
 
229 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.62 
 
 
285 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  34.06 
 
 
270 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  33.8 
 
 
226 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  31.9 
 
 
283 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  34.76 
 
 
229 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  32.77 
 
 
281 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  34.58 
 
 
217 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  32.49 
 
 
229 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  33.94 
 
 
295 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  31.91 
 
 
275 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  30.25 
 
 
267 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  30.7 
 
 
233 aa  101  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.24 
 
 
261 aa  101  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  28.98 
 
 
364 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  33.02 
 
 
303 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  32.56 
 
 
233 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  33.91 
 
 
276 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  32.7 
 
 
233 aa  99  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  34.12 
 
 
234 aa  99  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  31.63 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  29.74 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  32.64 
 
 
376 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  29.61 
 
 
294 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  31.63 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  34.29 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  31.62 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  31.76 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  31.62 
 
 
261 aa  95.1  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  32.72 
 
 
218 aa  95.1  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  30.14 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  32.13 
 
 
373 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  31.14 
 
 
361 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  31.62 
 
 
282 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  33.92 
 
 
342 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  29.82 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  34.11 
 
 
232 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  32.58 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>