More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1030 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  100 
 
 		 330 aa  672    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  99.39 
 
 		 330 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  87.88 
 
 		 330 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  50.46 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  51.23 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  50.76 
 
 		 333 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  50.91 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  50.76 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  48.61 
 
 		 342 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  52.28 
 
 		 333 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  48.02 
 
 		 333 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  49.85 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  49.85 
 
 		 333 aa  297  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  48.6 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  47.89 
 
 		 330 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  49.84 
 
 		 407 aa  295  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  49.38 
 
 		 328 aa  295  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  47.59 
 
 		 337 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  49.38 
 
 		 331 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  48.94 
 
 		 331 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  50.62 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  47.98 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  45.7 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  45.7 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  46.99 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  48.64 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  49.54 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  48.06 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  45.48 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  45.48 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  46.79 
 
 		 329 aa  285  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  48.94 
 
 		 333 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  46.15 
 
 		 331 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  45.59 
 
 		 330 aa  285  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  47.98 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  48.93 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  42.81 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  45.59 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  44.88 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  45.48 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  45.29 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  47.71 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  41.72 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  41.85 
 
 		 335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  45.54 
 
 		 335 aa  271  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  34.98 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  34.15 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  34.15 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  34.15 
 
 		 333 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  43.22 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  44.34 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  38.36 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  36.86 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  36.86 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  36.94 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  35.53 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  38.84 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  35.29 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  32.7 
 
 		 336 aa  175  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  30.86 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  32.72 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  29.94 
 
 		 339 aa  149  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.49 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  31.66 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  31.67 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.84 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.9 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  30.58 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  29.13 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  30.42 
 
 		 297 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  30.03 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.74 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  29.79 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.63 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.8 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  29.64 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  25.34 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  29.81 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  29.96 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.6 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  30.49 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  29.92 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  25.8 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.97 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1847  inosine-guanosine kinase  26.56 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.324608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  26.79 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  27.12 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  26.81 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3227  inosine kinase  27.2 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00215137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.81 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  29.39 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000207  inosine-guanosine kinase  25.77 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.471058  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  24.69 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  24.49 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  28.12 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>