More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1024 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  95.86 
 
 		 338 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  100 
 
 		 338 aa  668    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  100 
 
 		 338 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  75.45 
 
 		 335 aa  484  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  74.62 
 
 		 335 aa  484  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  70.27 
 
 		 333 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  71.86 
 
 		 335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.03 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  61.56 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  63.12 
 
 		 334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  65.31 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.38 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.67 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  62.62 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  62.19 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  61.25 
 
 		 346 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  63.86 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  63.47 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  61.56 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  62.2 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.69 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  61.3 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  61.92 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  65.25 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  63.69 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  61.61 
 
 		 335 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.06 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  62.73 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  57.14 
 
 		 343 aa  388  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  61.64 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  62.62 
 
 		 337 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  62.58 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.94 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  63.26 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.62 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.02 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  61.56 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.46 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.61 
 
 		 308 aa  332  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  49.69 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  47.72 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.72 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  49.07 
 
 		 321 aa  305  6e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  52.6 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.92 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.48 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.37 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  49.84 
 
 		 343 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 		 341 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  47.15 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.37 
 
 		 341 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.24 
 
 		 349 aa  292  5e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.67 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.99 
 
 		 327 aa  288  8e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.45 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.86 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  47.14 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  45.51 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.23 
 
 		 313 aa  269  5e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  41.59 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  45.39 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.44 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.39 
 
 		 325 aa  261  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.02 
 
 		 334 aa  259  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.34 
 
 		 341 aa  259  6e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  45.21 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.86 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.34 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  44.74 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  42.04 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  42.55 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  44.41 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  40.43 
 
 		 340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  40.62 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.6 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.09 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.77 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  41.03 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  45.14 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  41.35 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.13 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  38.91 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.6 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  41.35 
 
 		 332 aa  235  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.26 
 
 		 329 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  46.13 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.52 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  42.27 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.5 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  45.69 
 
 		 346 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  43.65 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.33 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  41.98 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  43.35 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.44 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  45.02 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  41.25 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  42.77 
 
 		 346 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>