56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0969 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  100 
 
 		 245 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  99.59 
 
 		 245 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  88.57 
 
 		 245 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  55.23 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  52.3 
 
 		 282 aa  224  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  51.69 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  51.69 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  43.5 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  43.57 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  43.75 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  44.21 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  40.08 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  41.98 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  39.51 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  38.62 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  39.67 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  36.67 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  36.67 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  36.67 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  37.92 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  35.56 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  36.89 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  37.14 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  38.27 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  36.07 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  34.58 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  36.82 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  34.17 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  34.17 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  36.09 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  35.71 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  33.62 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  34.17 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  37.92 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  38.42 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  40.34 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  37.19 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  32.9 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  32.08 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  32.08 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  31.67 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  31.33 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  31.93 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  28.09 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  30.67 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  26.64 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  27.23 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  28.27 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  26.79 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  29.29 
 
 		 301 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  26.23 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  26.67 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  31.62 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  29.72 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>