More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0865 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  100 
 
 
106 aa  215  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  215  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  96.23 
 
 
164 aa  213  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  74.26 
 
 
110 aa  161  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  70 
 
 
119 aa  159  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  72.16 
 
 
153 aa  159  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2518  iojap-like protein  77.65 
 
 
110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  59.8 
 
 
135 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  55.77 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  62.11 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  62.11 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  62.11 
 
 
137 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  61.05 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  57.14 
 
 
159 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  59.6 
 
 
153 aa  127  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  62.11 
 
 
168 aa  126  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  56.84 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  56.84 
 
 
117 aa  124  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  60.22 
 
 
142 aa  123  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  61.05 
 
 
150 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  54.81 
 
 
120 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  59.38 
 
 
166 aa  120  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  54.29 
 
 
141 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  59.38 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  53.33 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  52.38 
 
 
148 aa  116  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  60.87 
 
 
138 aa  116  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  52.94 
 
 
123 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  55.43 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  53.12 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  54.08 
 
 
210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  54.84 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  55.43 
 
 
109 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  53.68 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  52.13 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  51.02 
 
 
135 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  51.65 
 
 
105 aa  106  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0101  iojap-like protein  51.02 
 
 
99 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2870  iojap-like protein  51.58 
 
 
100 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3096  iojap-like protein  51.58 
 
 
100 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0645732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  46.88 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  48.96 
 
 
148 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  43.69 
 
 
115 aa  98.2  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  43.48 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  44.68 
 
 
122 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  48.39 
 
 
130 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  48.62 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  47.06 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  50.55 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  50 
 
 
226 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0662  Iojap-related protein  41.76 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  49.45 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  49.45 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  49.45 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  49.45 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  46.74 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  45.74 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  50.55 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  44.57 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  44.57 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  45.83 
 
 
109 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  47.25 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0323  hypothetical protein  44.44 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0834924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  45.74 
 
 
123 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  44.21 
 
 
116 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  47.25 
 
 
109 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  45.05 
 
 
108 aa  94  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  45.65 
 
 
117 aa  93.6  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  43.75 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  45.65 
 
 
118 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  47.25 
 
 
114 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  47.25 
 
 
114 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  47.25 
 
 
114 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  43.75 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  47.25 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  40.66 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  49.43 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  45.05 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  45.05 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  43.48 
 
 
400 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  45.56 
 
 
105 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  42.11 
 
 
105 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  42.11 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  42.11 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  42.11 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  44.12 
 
 
112 aa  90.9  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  38.95 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  42.22 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  44.12 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  43.4 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  45.05 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  45.05 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  45.16 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  43.16 
 
 
140 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  45.16 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  43 
 
 
117 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  45.16 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  41.05 
 
 
131 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  38.95 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  44.21 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>